RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591267.1

ATP5A1-216, Transcript of ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, human

TSL 5

Gene ATP5A1, Length 460 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5A1-216	ENST00000591267	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	MMP10	P09238	476 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	ZPR1	O75312	459 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	GYS1	P13807	737 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		28.14	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
ATP5A1-216	ENST00000591267	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	A1BG	P04217	495 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	COL15A1	P39059	1388 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	FKBP8	Q14318	412 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	GPR162	Q16538	588 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ATP5A1-216	ENST00000591267		A0A087WZG4	1122 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	APAF1	O14727	1248 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ATP5A1-216	ENST00000591267	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	DDR1	Q08345	913 aa		28	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	NFIX	Q14938	502 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	TM4SF1	P30408	202 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ATP5A1-216	ENST00000591267	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	YY1	P25490	414 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267		A0A0G2JLW4	131 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	UTRN	P46939	3433 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	MYL6B	P14649	208 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	SERPINB2	P05120	415 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	CHL1	O00533	1208 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	TGFB2	P61812	414 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	NPHP1	O15259	732 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	GRIN3B	O60391	1043 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	DPEP1	P16444	411 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ATP5A1-216	ENST00000591267	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	CFAP44	Q96MT7	982 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	BCS1L	Q9Y276	419 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	CHRNA5	P30532	468 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	GNAI1	P63096	354 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ATP5A1-216	ENST00000591267	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	ANXA1	P04083	346 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	HLF	Q16534	295 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ATP5A1-216	ENST00000591267	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04

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