RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	STARD3NL	O95772	234 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	ARX	Q96QS3	562 aa		28.9	■■■□□ 2.22
GPS1-222	ENST00000583983	APAF1	O14727	1248 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	RFC4	P35249	363 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GPS1-222	ENST00000583983	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	GYS1	P13807	737 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	COL15A1	P39059	1388 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	A1BG	P04217	495 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.78	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	CHL1	O00533	1208 aa		28.77	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
GPS1-222	ENST00000583983	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	ZPR1	O75312	459 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	MMP10	P09238	476 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983		A0A087WZG4	1122 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	FKBP8	Q14318	412 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	CFAP44	Q96MT7	982 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-222	ENST00000583983	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF853	P0CG23	659 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	IFT57	Q9NWB7	429 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	TM4SF1	P30408	202 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	GNAI1	P63096	354 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	DDR1	Q08345	913 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
GPS1-222	ENST00000583983	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	NFIX	Q14938	502 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	HOXB7	P09629	217 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	MYL6B	P14649	208 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GPS1-222	ENST00000583983	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	PDIA6	Q15084	440 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.57	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	IL16	Q14005	1332 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	RGL2	O15211	777 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	PROSER3	Q2NL68	480 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	SERPINB2	P05120	415 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	ANXA1	P04083	346 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GPS1-222	ENST00000583983	TGFB2	P61812	414 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	MIER1	Q8N108	512 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		28.5	■■■□□ 2.15

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