RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.17■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 STARD3NLO95772 234 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 POLD1P28340 1107 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 ARXQ96QS3 562 aa27.15■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 APAF1O14727 1248 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-226ENST00000570051 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 RFC4P35249 363 aa27.12■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.11■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.11■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 COL15A1P39059 1388 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 USP16Q9Y5T5 823 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 GYS1P13807 737 aa27.08■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RNPS1-226ENST00000570051 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 A1BGP04217 495 aa27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 SYT17Q9BSW7 474 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 CHL1O00533 1208 aa27.03■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 MMP10P09238 476 aa27.02■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 NARFQ9UHQ1 456 aa27.02■■□□□ 1.92
RNPS1-226ENST00000570051 ZPR1O75312 459 aa27.01■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.01■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 SCN7AQ01118 1682 aa27.01■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 A0A087WZG4 1122 aa27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 FKBP8Q14318 412 aa27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 FAM9BQ8IZU0 186 aa27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 KLHL34Q8N239 644 aa27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 CFAP44Q96MT7 982 aa27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.98■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 NBPF26B4DH59 902 aa26.98■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 NBPF15Q8N660 670 aa26.98■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF853P0CG23 659 aa26.97■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC27Q2M243 656 aa26.97■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.97■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 IFT57Q9NWB7 429 aa26.96■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 BCORQ6W2J9 1755 aa26.96■■□□□ 1.91
RNPS1-226ENST00000570051 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.95■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.94■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 MBIPQ9NS73 344 aa26.94■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.94■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 TM4SF1P30408 202 aa26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 GNAI1P63096 354 aa26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 DDR1Q08345 913 aa26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 KRT24Q2M2I5 525 aa26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 WWC1Q8IX03 1113 aa26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.93■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 CCER2I3L3R5 266 aa26.92■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.92■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 ERBB4Q15303 1308 aa26.91■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 CAMTA2O94983 1202 aa26.91■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.9■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 NFIXQ14938 502 aa26.9■■□□□ 1.9
RNPS1-226ENST00000570051 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.87■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 HOXB7P09629 217 aa26.87■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 MYL6BP14649 208 aa26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 PDIA6Q15084 440 aa26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.85■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 IL16Q14005 1332 aa26.85■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.84■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 RGL2O15211 777 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 PROSER3Q2NL68 480 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 NGEFQ8N5V2 710 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 NECTIN2Q92692 538 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-226ENST00000570051 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.82■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 SERPINB2P05120 415 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 WDR63Q8IWG1 891 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms