RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 USP16Q9Y5T5 823 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 AAMPQ13685 434 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 ATG3Q9NT62 314 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 PDIA6Q15084 440 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
HERC2-208ENST00000566635 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 IGHDP01880 384 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 MYL6BP14649 208 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 HYPKQ9NX55 129 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 ADCY9O60503 1353 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 TJP1Q07157 1748 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 KCNQ2O43526 872 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 FAM182BQ5T319 152 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 MEIS3Q99687 375 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HERC2-208ENST00000566635 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.33■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.33■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 NBPF26B4DH59 902 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 NBPF14Q5TI25 921 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 NBPF15Q8N660 670 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 A1BGP04217 495 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 SKAP1Q86WV1 359 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 NHSQ6T4R5 1651 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 ERBB4Q15303 1308 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 COPS6Q7L5N1 327 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 KSR2Q6VAB6 950 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 ATP10DQ9P241 1426 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 BEND3Q5T5X7 828 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 PALLDQ8WX93 1383 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 BTAF1O14981 1849 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 SBF2Q86WG5 1849 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC2-208ENST00000566635 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 FBXO41Q8TF61 875 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 STARD3NLO95772 234 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 EP400Q96L91 3159 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 USP44Q9H0E7 712 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 SIK1P57059 783 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 CEP85Q6P2H3 762 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 GNAI3P08754 354 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 ATP6V1AP38606 617 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 MYD88Q99836 296 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC2-208ENST00000566635 GNAI2P04899 355 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 IGKV5-2P06315 115 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ITPK1Q13572 414 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.19■■□□□ 1.14
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