RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	RASA1	P20936	1047 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	PSME1	Q06323	249 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.06	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	F11	P03951	625 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.05	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	USP4	Q13107	963 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	CLN3	Q13286	438 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LRRC28-222	ENST00000561431	ATG7	O95352	703 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CHRNA4	P43681	627 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	GTF2I	P78347	998 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L21	D6R901	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L22	D6RA61	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	GNB5	O14775	395 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM196B	A6NMK8	535 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	C2CD2L	O14523	706 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	AMPD1	P23109	780 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	SCTR	P47872	440 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	UST	Q9Y2C2	406 aa		6.99	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	SCRIB	Q14160	1630 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	DGKG	P49619	791 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	GGA1	Q9UJY5	639 aa		6.98	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	PIK3R2	O00459	728 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CLDN10	P78369	228 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	DPYD	Q12882	1025 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	PTK7	Q13308	1070 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	DOC2B	Q14184	412 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC102B	Q68D86	513 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	BTBD6	Q96KE9	485 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A1B0GTH6	734 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LRRC28-222	ENST00000561431	CARNS1	A5YM72	827 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LRRC28-222	ENST00000561431	BMP4	P12644	408 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LRRC28-222	ENST00000561431	PHKA2	P46019	1235 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LRRC28-222	ENST00000561431	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LRRC28-222	ENST00000561431	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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