RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 PPP2R1AP30153 589 aa26.92■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 TEFQ10587 303 aa26.92■■□□□ 1.9
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MFGE8-208ENST00000558773 PRKAR2BP31323 418 aa26.91■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.91■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.91■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 COL15A1P39059 1388 aa26.9■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.9■■□□□ 1.9
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MFGE8-208ENST00000558773 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
MFGE8-208ENST00000558773 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.89■■□□□ 1.9
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MFGE8-208ENST00000558773 FCHSD2O94868 740 aa26.88■■□□□ 1.89
MFGE8-208ENST00000558773 STARD3NLO95772 234 aa26.88■■□□□ 1.89
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MFGE8-208ENST00000558773 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
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MFGE8-208ENST00000558773 KCNQ3O43525 872 aa26.81■■□□□ 1.88
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MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.74■■□□□ 1.87
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MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.73■■□□□ 1.87
MFGE8-208ENST00000558773 USP16Q9Y5T5 823 aa26.73■■□□□ 1.87
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MFGE8-208ENST00000558773 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.71■■□□□ 1.87
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MFGE8-208ENST00000558773 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.65■■□□□ 1.86
MFGE8-208ENST00000558773 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.65■■□□□ 1.86
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MFGE8-208ENST00000558773 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.61■■□□□ 1.85
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MFGE8-208ENST00000558773 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.58■■□□□ 1.85
MFGE8-208ENST00000558773 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
MFGE8-208ENST00000558773 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MFGE8-208ENST00000558773 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
MFGE8-208ENST00000558773 NFKBIEO00221 500 aa26.56■■□□□ 1.84
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
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MFGE8-208ENST00000558773 RALBP1Q15311 655 aa26.55■■□□□ 1.84
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.55■■□□□ 1.84
MFGE8-208ENST00000558773 SRGNP10124 158 aa26.54■■□□□ 1.84
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