RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 CHRNA5P30532 468 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 LGR6Q9HBX8 967 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 TJP1Q07157 1748 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 FSTL1Q12841 308 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 NARFQ9UHQ1 456 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 HMOX1P09601 288 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC39A6Q13433 755 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 COL15A1P39059 1388 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 NFIXQ14938 502 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 MRC1P22897 1456 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 STARD3NLO95772 234 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 SERPINB2P05120 415 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 RRAGCQ9HB90 399 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.25■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 A0A087WZG4 1122 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 LMNB1P20700 586 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 TTLL6Q8N841 843 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 H0YIN7 160 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 KLRG1Q96E93 195 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.21■■□□□ 1.15
NEK9-211ENST00000557673 PPP2R1AP30153 589 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 TEFQ10587 303 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 GLTPD2A6NH11 291 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 RASSF7Q02833 373 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 CFAP53Q96M91 514 aa22.19■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 WDR90Q96KV7 1748 aa22.18■■□□□ 1.14
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NEK9-211ENST00000557673 HTRA3P83110 453 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.18■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 SBF1O95248 1867 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 JMYQ8N9B5 988 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.17■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 PDE6BP35913 854 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 RALBP1Q15311 655 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 ZNF790Q6PG37 636 aa22.16■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.15■■□□□ 1.14
NEK9-211ENST00000557673 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 IL17REQ8NFR9 667 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 NFKBIEO00221 500 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 NPHP1O15259 732 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 PRKAR2BP31323 418 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 SETDB2Q96T68 719 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 PRELPP51888 382 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 NUDCQ9Y266 331 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.09■■□□□ 1.13
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NEK9-211ENST00000557673 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 CNBD1Q8NA66 436 aa22.08■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.08■■□□□ 1.13
NEK9-211ENST00000557673 BTBD11A6QL63 1104 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 C21orf2O43822 256 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 ST5P78524 1137 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 ERFEQ4G0M1 354 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 SOGA3Q5TF21 947 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 CNKSR1Q969H4 720 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.06■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 A1BGP04217 495 aa22.05■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 STYK1Q6J9G0 422 aa22.05■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.05■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 CAMTA2O94983 1202 aa22.04■■□□□ 1.12
NEK9-211ENST00000557673 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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