RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	COL18A1	P39060	1754 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	FOXO3	O43524	673 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	STAP2	Q9UGK3	403 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	RAD50	Q92878	1312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	IGSF3	O75054	1194 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	UTY	O14607	1347 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	CABP4	P57796	275 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	CNTROB	Q8N137	903 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	PHKG2	P15735	406 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	SLAIN2	Q9P270	581 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	IL2RB	P14784	551 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	SOX12	O15370	315 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	AK7	Q96M32	723 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ATG3	Q9NT62	314 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	EVA1C	P58658	441 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	NUCB2	P80303	420 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ORAI2	Q96SN7	254 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	FAM83G	A6ND36	823 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	POLA2	Q14181	598 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	FBXO41	Q8TF61	875 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.36	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF790	Q6PG37	636 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	BRINP3	Q76B58	766 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ABCA3	Q99758	1704 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	MX1	P20591	662 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	DCTN1	Q14203	1278 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	STRC	Q7RTU9	1775 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667		A0A087WZG4	1122 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	STARD3NL	O95772	234 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RBM23-233	ENST00000557667	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	GRM8	O00222	908 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	PSMA5	P28066	241 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	NT5C2	P49902	561 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	KRT32	Q14532	448 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	PDE1A	P54750	535 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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