RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.71□□□□□ -0.85
CS-204ENST00000546621 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 TEFQ10587 303 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 FAM161AQ3B820 660 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 STK31Q9BXU1 1019 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 MEGF6O75095 1541 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 CACNA1FO60840 1977 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SMC5Q8IY18 1101 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 MAP7D2Q96T17 732 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 BTBD11A6QL63 1104 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 HOXB7P09629 217 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 C8orf34Q49A92 452 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 G2E3Q7L622 706 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.862e-10■■■□□ 15.7
CS-204ENST00000546621 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 HOMEZQ8IX15 550 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SPG7Q9UQ90 795 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 FLIIQ13045 1269 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 NFKBIBQ15653 356 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 KCNQ3O43525 872 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 PHKG2P15735 406 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 NECTIN2Q92692 538 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 GCC1Q96CN9 775 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 ATP10DQ9P241 1426 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 F6X3S4 739 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 NUCB1Q02818 461 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 MRC1P22897 1456 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 MEIS3Q99687 375 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-204ENST00000546621 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 DCAF5Q96JK2 942 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 CYP27B1O15528 508 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 CEP85Q6P2H3 762 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 ZNF790Q6PG37 636 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 LNPKQ9C0E8 428 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 GNAI3P08754 354 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 HSPA1LP34931 641 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 TERF1P54274 439 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 DCTPP1Q9H773 170 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 C5P01031 1676 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 GNAI2P04899 355 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 POTEIP0CG38 1075 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 EVA1CP58658 441 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 STRN4Q9NRL3 753 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms