RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		21.61	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		21.61	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	COL15A1	P39059	1388 aa		21.61	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		21.6	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	CHRNA5	P30532	468 aa		21.6	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		21.6	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		21.59	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	TEF	Q10587	303 aa		21.59	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		21.59	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	HSPA6	P17066	643 aa		21.58	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	NFIX	Q14938	502 aa		21.58	■■□□□ 1.05
DDX11-222	ENST00000542777	STARD3NL	O95772	234 aa		21.57	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		21.57	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		21.57	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF790	Q6PG37	636 aa		21.56	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	CFAP53	Q96M91	514 aa		21.56	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		21.54	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	SERPINB2	P05120	415 aa		21.54	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	21.54	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		21.53	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777		A0A087WZG4	1122 aa		21.53	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	PRKAR2B	P31323	418 aa		21.53	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		21.53	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		21.52	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		21.52	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	NUDC	Q9Y266	331 aa		21.52	■■□□□ 1.04
DDX11-222	ENST00000542777	TOMM70	O94826	608 aa		21.51	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		21.51	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		21.51	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	RNF181	Q9P0P0	153 aa		21.51	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		21.5	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	BTBD11	A6QL63	1104 aa		21.49	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	SBF1	O95248	1867 aa		21.49	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	KCNQ3	O43525	872 aa		21.48	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	A1BG	P04217	495 aa		21.48	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	PPP2R1A	P30153	589 aa		21.48	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		21.48	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		21.48	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	21.47	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		21.47	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	CEP350	Q5VT06	3117 aa		21.47	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		21.46	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777		H0YIN7	160 aa		21.46	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	TTLL6	Q8N841	843 aa		21.46	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		21.46	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		21.46	■■□□□ 1.03
DDX11-222	ENST00000542777	RASSF7	Q02833	373 aa		21.45	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	APLP1	P51693	650 aa		21.44	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	SCN7A	Q01118	1682 aa		21.44	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	MCM10	Q7L590	875 aa		21.43	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	USP16	Q9Y5T5	823 aa		21.43	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	RRAGC	Q9HB90	399 aa		21.42	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	CAMTA2	O94983	1202 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	LMNB1	P20700	586 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	PDE6B	P35913	854 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		21.41	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	21.4	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	SETDB2	Q96T68	719 aa		21.4	■■□□□ 1.02
DDX11-222	ENST00000542777	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	PRELP	P51888	382 aa		21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	DCTN1	Q14203	1278 aa		21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		21.39	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	NPHP1	O15259	732 aa		21.38	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	NFKBIE	O00221	500 aa		21.37	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	CNBD1	Q8NA66	436 aa		21.37	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		21.36	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	FSTL1	Q12841	308 aa		21.36	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	C21orf2	O43822	256 aa		21.35	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	ST5	P78524	1137 aa		21.35	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		21.35	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	GLTPD2	A6NH11	291 aa		21.34	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		21.34	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	NEFM	P07197	916 aa		21.33	■■□□□ 1.01
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		21.33	■■□□□ 1.01

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