RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 DPEP1P16444 411 aa24.71■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 SLC39A6Q13433 755 aa24.71■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 FKBP8Q14318 412 aa24.71■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.71■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.71■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PUF60-218ENST00000531995 TGFB2P61812 414 aa24.7■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 DDR1Q08345 913 aa24.69■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 MRS2Q9HD23 443 aa24.67■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 COL15A1P39059 1388 aa24.66■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.64■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.64■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.64■■□□□ 1.54
PUF60-218ENST00000531995 SCN7AQ01118 1682 aa24.64■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.64■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.64■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 MIER1Q8N108 512 aa24.63■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.63■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 ZPR1O75312 459 aa24.61■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 KCNA3P22001 575 aa24.61■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 CHRNA5P30532 468 aa24.61■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.61■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 KIF3CO14782 793 aa24.6■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 IL17REQ8NFR9 667 aa24.59■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 RUNDC1Q96C34 613 aa24.58■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 PIM2Q9P1W9 311 aa24.58■■□□□ 1.53
PUF60-218ENST00000531995 SBF1O95248 1867 aa24.58■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.57■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 CCER2I3L3R5 266 aa24.57■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 NFE2L2Q16236 605 aa24.57■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.57■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 HSPA6P17066 643 aa24.56■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 TM4SF1P30408 202 aa24.55■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 NFIXQ14938 502 aa24.55■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 NARFQ9UHQ1 456 aa24.55■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.55■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.55■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 BCORQ6W2J9 1755 aa24.54■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 TEFQ10587 303 aa24.53■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.53■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.53■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.53■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 DCTN1Q14203 1278 aa24.52■■□□□ 1.52
PUF60-218ENST00000531995 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 NEFMP07197 916 aa24.51■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.51■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 CACNA1SQ13698 1873 aa24.51■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 MCM10Q7L590 875 aa24.5■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 RNF181Q9P0P0 153 aa24.5■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 RIPK4P57078 832 aa24.49■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 ZNF790Q6PG37 636 aa24.49■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.49■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.49■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 APAF1O14727 1248 aa24.48■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 STARD3NLO95772 234 aa24.48■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 RASSF7Q02833 373 aa24.48■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.48■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.48■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 WDR90Q96KV7 1748 aa24.47■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 SERPINB2P05120 415 aa24.47■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PUF60-218ENST00000531995 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 NEUROD2Q15784 382 aa24.44■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 KCNQ3O43525 872 aa24.43■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 TOMM70O94826 608 aa24.43■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.43■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.43■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.43■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 A0A087WZG4 1122 aa24.42■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.42■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.42■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 BTBD11A6QL63 1104 aa24.41■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.41■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 A1BGP04217 495 aa24.4■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.39■■□□□ 1.5
PUF60-218ENST00000531995 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms