RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	INHA	P05111	366 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	GDF10	P55107	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FAM49B-222	ENST00000522702	ADH6	P28332	368 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	SMTN	P53814	917 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PNR3	127 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8N3U1	123 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	DGKG	P49619	791 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	SCNN1D	P51172	638 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	TNP2	Q05952	138 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK2AP1	O14519	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	CD33	P20138	364 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP4A	P20648	1035 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	VAC14	Q08AM6	782 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	FLII	Q13045	1269 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	IRF5	Q13568	498 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	WASHC4	Q2M389	1173 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NJY4	79 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ALAS2	P22557	587 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNA4	P43681	627 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	DOC2B	Q14184	412 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	MCM6	Q14566	821 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ABL2	P42684	1182 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	GATA4	P43694	442 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	BACH1	O14867	736 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	MTFR1	Q15390	333 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	SOX11	P35716	441 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	EML3	Q32P44	896 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NJR5	290 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	APBA3	O96018	575 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	PSME1	Q06323	249 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	EFS	O43281	561 aa		7.19	□□□□□ -1.26
FAM49B-222	ENST00000522702	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26

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