RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 MRS2Q9HD23 443 aa20.33■□□□□ 0.85
TSNARE1-206ENST00000520462 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 ADRA2BP18089 450 aa20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.32■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 RPS6KA4O75676 772 aa20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 NEUROD2Q15784 382 aa20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.3■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 CEP350Q5VT06 3117 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A0G2JLW4 131 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 GYS1P13807 737 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC184Q52MB2 194 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 ADCY9O60503 1353 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.29■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 TGFB2P61812 414 aa20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 BCS1LQ9Y276 419 aa20.28■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TSNARE1-206ENST00000520462 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 STARD3NLO95772 234 aa20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.26■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 C4AP0C0L4 1744 aa20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNQ3O43525 872 aa20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 DPEP1P16444 411 aa20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 APAF1O14727 1248 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 FKBP8Q14318 412 aa20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1-206ENST00000520462 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.19■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 ZPR1O75312 459 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 DDR1Q08345 913 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 PIM2Q9P1W9 311 aa20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 HSPA6P17066 643 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 USP16Q9Y5T5 823 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 COL15A1P39059 1388 aa20.16■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A087WZG4 1122 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF3CO14782 793 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNA3P22001 575 aa20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1-206ENST00000520462 A1BGP04217 495 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 CHRNA5P30532 468 aa20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 TM4SF1P30408 202 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 NARFQ9UHQ1 456 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 CHL1O00533 1208 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP44Q96MT7 982 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 GNAI1P63096 354 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 NFIXQ14938 502 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 TOMM70O94826 608 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC27Q2M243 656 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 IFT57Q9NWB7 429 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF181Q9P0P0 153 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-206ENST00000520462 CCER2I3L3R5 266 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-206ENST00000520462 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-206ENST00000520462 SERPINB2P05120 415 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-206ENST00000520462 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.3 ms