RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 RFC4P35249 363 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 ADRA2BP18089 450 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 ARXQ96QS3 562 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 COL15A1P39059 1388 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PITX1-204ENST00000504936 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.88■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.87■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 ZPR1O75312 459 aa24.86■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 A1BGP04217 495 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 USP16Q9Y5T5 823 aa24.84■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 SCN7AQ01118 1682 aa24.83■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PITX1-204ENST00000504936 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 A0A087WZG4 1122 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 MMP10P09238 476 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 GYS1P13807 737 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.81■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 BCORQ6W2J9 1755 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 SYT17Q9BSW7 474 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 NARFQ9UHQ1 456 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-204ENST00000504936 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 FKBP8Q14318 412 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 CHL1O00533 1208 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 GNAI1P63096 354 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 NGEFQ8N5V2 710 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 CFAP44Q96MT7 982 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 NECTIN2Q92692 538 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 IFT57Q9NWB7 429 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 MYL6BP14649 208 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 MBIPQ9NS73 344 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 KRT24Q2M2I5 525 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 NBPF26B4DH59 902 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 NBPF15Q8N660 670 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 NUP98P52948 1817 aa24.7■■□□□ 1.55
PITX1-204ENST00000504936 CCER2I3L3R5 266 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 CCDC27Q2M243 656 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 WWC1Q8IX03 1113 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 NPHP1O15259 732 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 DDR1Q08345 913 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 NFIXQ14938 502 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 ERBB4Q15303 1308 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 CAMTA2O94983 1202 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 ZNF853P0CG23 659 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 ANXA1P04083 346 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 MIER1Q8N108 512 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-204ENST00000504936 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 GPR162Q16538 588 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 HOXB7P09629 217 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 TM4SF1P30408 202 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-204ENST00000504936 IL16Q14005 1332 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms