RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.99□□□□□ -1.45
RBM39-242ENST00000498280 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.98□□□□□ -1.45
RBM39-242ENST00000498280 GATA4P43694 442 aa5.98□□□□□ -1.45
RBM39-242ENST00000498280 TLR1Q15399 786 aa5.98□□□□□ -1.45
RBM39-242ENST00000498280 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.98□□□□□ -1.45
RBM39-242ENST00000498280 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RBM39-242ENST00000498280 HCN2Q9UL51 889 aa5.98□□□□□ -1.45
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RBM39-242ENST00000498280 VAC14Q08AM6 782 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 NLRP8Q86W28 1048 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 FAM182BQ5T319 152 aa5.95□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 SCNN1DP51172 638 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.94□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.94□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.93□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 TRIM11Q96F44 468 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 USP3Q9Y6I4 520 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 PIK3CDO00329 1044 aa5.92□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 ABL2P42684 1182 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 USP4Q13107 963 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 PLVAPQ9BX97 442 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.92□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.91□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 NACC1Q96RE7 527 aa5.91□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 NBPF11Q86T75 865 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-242ENST00000498280 AIDAQ96BJ3 306 aa5.9□□□□□ -1.46
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RBM39-242ENST00000498280 INHAP05111 366 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 ALAS2P22557 587 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 TNP2Q05952 138 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.88□□□□□ -1.47
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RBM39-242ENST00000498280 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 ELOA3Q8NG57 546 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 MARK1Q9P0L2 795 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.86□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 STRN4Q9NRL3 753 aa5.86□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.86□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 MCM6Q14566 821 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 ZIC5Q96T25 663 aa5.85□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 A6NJY4 79 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 EFSO43281 561 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 TXLNAP40222 546 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 SYT9Q86SS6 491 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 POM121Q96HA1 1249 aa5.84□□□□□ -1.47
RBM39-242ENST00000498280 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.84□□□□□ -1.47
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