RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497146.5

PTGER3-211, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,971 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-211ENST00000497146 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.75■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.75■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 PROSER3Q2NL68 480 aa26.75■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 KSR2Q6VAB6 950 aa26.75■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 SLC4A3P48751 1232 aa26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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PTGER3-211ENST00000497146 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.73■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.73■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 ALDH1L1O75891 902 aa26.73■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.72■■□□□ 1.87
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PTGER3-211ENST00000497146 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.71■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 APBB1O00213 710 aa26.71■■□□□ 1.87
PTGER3-211ENST00000497146 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 TTC22Q5TAA0 569 aa26.69■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.69■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.68■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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PTGER3-211ENST00000497146 SSH3Q8TE77 659 aa26.67■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.67■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 BTG4Q9NY30 223 aa26.67■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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PTGER3-211ENST00000497146 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 LINS1Q8NG48 757 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 GLI3P10071 1580 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 CDC45O75419 566 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 BCL11AQ9H165 835 aa26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 ERBB4Q15303 1308 aa26.64■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.64■■□□□ 1.86
PTGER3-211ENST00000497146 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.64■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 POLA2Q14181 598 aa26.64■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.64■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.63■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 PHLPP1O60346 1717 aa26.63■■□□□ 1.85
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PTGER3-211ENST00000497146 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 USP16Q9Y5T5 823 aa26.62■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 RAB11FIP3O75154 756 aa26.62■■□□□ 1.85
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PTGER3-211ENST00000497146 SRGAP3O43295 1099 aa26.61■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 USP35Q9P2H5 1018 aa26.61■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 PDE1AP54750 535 aa26.6■■□□□ 1.85
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PTGER3-211ENST00000497146 MTX1Q13505 466 aa26.6■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 CASC1Q6TDU7 716 aa26.6■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.59■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.59■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.59■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.59■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 GRM8O00222 908 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 COPS6Q7L5N1 327 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 TNS2Q63HR2 1409 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 UTYO14607 1347 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 SDSP20132 328 aa26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PTGER3-211ENST00000497146 DISP2A7MBM2 1401 aa26.58■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.57■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 NBR1Q14596 966 aa26.57■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.57■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 MX1P20591 662 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.55■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 LRP6O75581 1613 aa26.54■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 IGKV5-2P06315 115 aa26.53■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 STAP2Q9UGK3 403 aa26.53■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 AOX1Q06278 1338 aa26.53■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.53■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 TOM1O60784 492 aa26.52■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 MYT1Q01538 1121 aa26.52■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.52■■□□□ 1.84
PTGER3-211ENST00000497146 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.51■■□□□ 1.83
PTGER3-211ENST00000497146 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.51■■□□□ 1.83
PTGER3-211ENST00000497146 MYD88Q99836 296 aa26.51■■□□□ 1.83
PTGER3-211ENST00000497146 GCKRQ14397 625 aa26.5■■□□□ 1.83
PTGER3-211ENST00000497146 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTGER3-211ENST00000497146 ITGB4P16144 1822 aa26.49■■□□□ 1.83
PTGER3-211ENST00000497146 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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