RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 A0A1B0GTH6 734 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 SLC35F4A4IF30 521 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 PHKA2P46019 1235 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 PLA2G4AP47712 749 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 TEAD4Q15561 434 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.56□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.55□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 USP3Q9Y6I4 520 aa8.55□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 SERTM1A2A2V5 107 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 IGFBP4P22692 258 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 PDE4CQ08493 712 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 TBCELQ5QJ74 424 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.54□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 H3BM21 787 aa8.53□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 PPFIA3O75145 1194 aa8.53□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 F11P03951 625 aa8.53□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 NOS2P35228 1153 aa8.53□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 USTQ9Y2C2 406 aa8.53□□□□□ -1.04
PTEN-204ENST00000487939 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 WEE1P30291 646 aa8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 AIDAQ96BJ3 306 aa8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.52□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 H7C1W4 665 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 FOXO3O43524 673 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 C21orf2O43822 256 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ITGA6P23229 1130 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 MSX1P28360 303 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 PGBD3Q8N328 593 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 GMCL1Q96IK5 515 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ERBB4Q15303 1308 aa8.51□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 EML1O00423 815 aa8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 LGR5O75473 907 aa8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 POTEAQ6S8J7 498 aa8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.5□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 PRMT3O60678 531 aa8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 VEGFBP49765 207 aa8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 GPAMQ9HCL2 828 aa8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.48□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.48□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 RETREG2Q8NC44 543 aa8.48□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ATP4AP20648 1035 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ATP2B4P23634 1241 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 TXLNAP40222 546 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 OCLNQ16625 522 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 EFHC2Q5JST6 749 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTEN-204ENST00000487939 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.46□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.46□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 SV2AQ7L0J3 742 aa8.46□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.46□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.46□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 CDC14CA4D256 554 aa8.45□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.45□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.45□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 RUBCNLQ9H714 662 aa8.45□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.45□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.45□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 VSIG8P0DPA2 414 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 HIF1AQ16665 826 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 NLRP8Q86W28 1048 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 COL26A1Q96A83 441 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 NGLY1Q96IV0 654 aa8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 A0A1W2PNR3 127 aa8.43□□□□□ -1.06
PTEN-204ENST00000487939 DBN1Q16643 649 aa8.43□□□□□ -1.06
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