RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 NEUROD2Q15784 382 aa27.36■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 MRS2Q9HD23 443 aa27.36■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.36■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.35■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 COL15A1P39059 1388 aa27.34■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 KLHL34Q8N239 644 aa27.34■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 SCN7AQ01118 1682 aa27.33■■□□□ 1.97
NELFE-208ENST00000481121 SYT17Q9BSW7 474 aa27.31■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 GYS1P13807 737 aa27.3■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 BCORQ6W2J9 1755 aa27.29■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.29■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.28■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.28■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.28■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 APAF1O14727 1248 aa27.27■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.27■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 USP16Q9Y5T5 823 aa27.26■■□□□ 1.96
NELFE-208ENST00000481121 ZPR1O75312 459 aa27.26■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 MMP10P09238 476 aa27.26■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 A1BGP04217 495 aa27.24■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.24■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.23■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 NARFQ9UHQ1 456 aa27.23■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 A0A087WZG4 1122 aa27.22■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.21■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 FKBP8Q14318 412 aa27.21■■□□□ 1.95
NELFE-208ENST00000481121 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.2■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.19■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.19■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.18■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.17■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 CHL1O00533 1208 aa27.16■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.16■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.15■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 UTRNP46939 3433 aa27.15■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 NBPF26B4DH59 902 aa27.14■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 DDR1Q08345 913 aa27.14■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 NBPF15Q8N660 670 aa27.14■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 CFAP44Q96MT7 982 aa27.14■■□□□ 1.94
NELFE-208ENST00000481121 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.12■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 NUP98P52948 1817 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 CHD4Q14839 1912 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 TM4SF1P30408 202 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 NFIXQ14938 502 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 IFT57Q9NWB7 429 aa27.11■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 CAMTA2O94983 1202 aa27.1■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 ERBB4Q15303 1308 aa27.1■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 GNAI1P63096 354 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 CCDC27Q2M243 656 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 MBIPQ9NS73 344 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.09■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NELFE-208ENST00000481121 ZNF853P0CG23 659 aa27.07■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 KRT24Q2M2I5 525 aa27.07■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.07■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 MYL6BP14649 208 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 GPR162Q16538 588 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.06■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 WWC1Q8IX03 1113 aa27.05■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 NGEFQ8N5V2 710 aa27.05■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.04■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.03■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 SERPINB2P05120 415 aa27.03■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 HOXB7P09629 217 aa27.03■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 TGFB2P61812 414 aa27.03■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.02■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 NECTIN2Q92692 538 aa27.02■■□□□ 1.92
NELFE-208ENST00000481121 RGL2O15211 777 aa27.01■■□□□ 1.91
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