RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462626.1

EML3-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 2

Gene EML3, Length 463 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-208	ENST00000462626	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.25	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	TEF	Q10587	303 aa		28.25	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.25	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.24	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.23	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	STARD3NL	O95772	234 aa		28.22	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.21	■■■□□ 2.11
EML3-208	ENST00000462626	FCHSD2	O94868	740 aa		28.2	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	NFIX	Q14938	502 aa		28.2	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.2	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.19	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.18	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.17	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.15	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.14	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626		A0A087WZG4	1122 aa		28.14	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	CHRNA5	P30532	468 aa		28.14	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.14	■■■□□ 2.1
EML3-208	ENST00000462626	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.13	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	KCNQ3	O43525	872 aa		28.12	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	SERPINB2	P05120	415 aa		28.11	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	KIF3C	O14782	793 aa		28.08	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	MCM10	Q7L590	875 aa		28.08	■■■□□ 2.09
EML3-208	ENST00000462626	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	A1BG	P04217	495 aa		28.07	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.06	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.05	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.04	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.03	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.03	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.03	■■■□□ 2.08
EML3-208	ENST00000462626	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.01	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.01	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626		H0YIN7	160 aa		27.98	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	HSPA6	P17066	643 aa		27.98	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.98	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.97	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		27.96	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.96	■■■□□ 2.07
EML3-208	ENST00000462626	NEFM	P07197	916 aa		27.95	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.95	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	SBF1	O95248	1867 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	TOMM70	O94826	608 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	PDE6B	P35913	854 aa		27.94	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	RASSF7	Q02833	373 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	RGL2	O15211	777 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.89	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	LMNB1	P20700	586 aa		27.89	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	PRELP	P51888	382 aa		27.89	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
EML3-208	ENST00000462626	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
EML3-208	ENST00000462626	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EML3-208	ENST00000462626	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
EML3-208	ENST00000462626	NFKBIE	O00221	500 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EML3-208	ENST00000462626	RALBP1	Q15311	655 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EML3-208	ENST00000462626	ST5	P78524	1137 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EML3-208	ENST00000462626	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.86	■■■□□ 2.05

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