RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 TNS4Q8IZW8 715 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 TIAM1Q13009 1591 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 DIP2AQ14689 1571 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP1Q9C000 1473 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 BAG6P46379 1132 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 10.9
RABGGTB-203ENST00000459697 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.095e-6■■■□□ 18.2
RABGGTB-203ENST00000459697 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 UNC13BO14795 1591 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 ATRNO75882 1429 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 MIA2Q96PC5 1412 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 ERFEQ4G0M1 354 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCC3O15438 1527 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 TTLL8A6PVC2 850 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNA6P17658 529 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 PZPP20742 1482 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 CHD4Q14839 1912 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 HSPA6P17066 643 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 LTKP29376 864 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-203ENST00000459697 PTSQ03393 145 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CBLBQ13191 982 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 PLXNC1O60486 1568 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6ZVU0 165 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB33Q86T24 672 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 A2MP01023 1474 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 C14orf37Q86TY3 774 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SPON1Q9HCB6 807 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SPINT1O43278 529 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 NCOA2Q15596 1464 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNMA1Q12791 1236 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 BRINP3Q76B58 766 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 EID1Q9Y6B2 187 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SAMD9Q5K651 1589 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT76Q01546 638 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 PTK2Q05397 1052 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 NR6A1Q15406 480 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNQ2O43526 872 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 ATF3P18847 181 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 RELBQ01201 579 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-203ENST00000459697 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 PCNTO95613 3336 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC35F4A4IF30 521 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-203ENST00000459697 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.2 ms