RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 STARD3NLO95772 234 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 POLD1P28340 1107 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 ARXQ96QS3 562 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 USP16Q9Y5T5 823 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.64■□□□□ 0.9
ACTB-206ENST00000443528 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 RFC4P35249 363 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 A1BGP04217 495 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 C4AP0C0L4 1744 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 GYS1P13807 737 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 COL15A1P39059 1388 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 CHL1O00533 1208 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 SYT17Q9BSW7 474 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-206ENST00000443528 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 FKBP8Q14318 412 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 NARFQ9UHQ1 456 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 NBPF26B4DH59 902 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 ZPR1O75312 459 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 MMP10P09238 476 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 ZNF853P0CG23 659 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 NBPF15Q8N660 670 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 CFAP44Q96MT7 982 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 A0A087WZG4 1122 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 CCDC27Q2M243 656 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 KLHL34Q8N239 644 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 KRT24Q2M2I5 525 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 MBIPQ9NS73 344 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-206ENST00000443528 TM4SF1P30408 202 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 WWC1Q8IX03 1113 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 IFT57Q9NWB7 429 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 CCER2I3L3R5 266 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 DDR1Q08345 913 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 CAMTA2O94983 1202 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 GNAI1P63096 354 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 NFIXQ14938 502 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 SCN7AQ01118 1682 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 PDIA6Q15084 440 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 ERBB4Q15303 1308 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-206ENST00000443528 MYL6BP14649 208 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 HOXB7P09629 217 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 MIER1Q8N108 512 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 NGEFQ8N5V2 710 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 NECTIN2Q92692 538 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 PROSER3Q2NL68 480 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 IL16Q14005 1332 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 BCORQ6W2J9 1755 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 ANXA1P04083 346 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 WDR63Q8IWG1 891 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB2P05120 415 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 HLFQ16534 295 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 RGL2O15211 777 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.39■□□□□ 0.86
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.39■□□□□ 0.85
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