RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TNS2Q63HR2 1409 aa8.52□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 F6X3S4 739 aa8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARXQ96QS3 562 aa8.51□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ATRNO75882 1429 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STARD3NLO95772 234 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KCNQ2O43526 872 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A1BGP04217 495 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RXRBP28702 533 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ATP6V1AP38606 617 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PROSER3Q2NL68 480 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM182BQ5T319 152 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KSR2Q6VAB6 950 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COPS6Q7L5N1 327 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MRC1P22897 1456 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ABCC4O15439 1325 aa8.49□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BCL9O00512 1426 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDIA6Q15084 440 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ERBB4Q15303 1308 aa8.48□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.47□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GNAI3P08754 354 aa8.47□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.47□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.47□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.47□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CACNA1FO60840 1977 aa8.47□□□□□ -1.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ITGB4P16144 1822 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF26B4DH59 902 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SIK1P57059 783 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF14Q5TI25 921 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBPF15Q8N660 670 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.46□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GLI3P10071 1580 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ALDH1L1O75891 902 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IGHDP01880 384 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GNAI2P04899 355 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BEND3Q5T5X7 828 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MYD88Q99836 296 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PALLDQ8WX93 1383 aa8.45□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LINS1Q8NG48 757 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MEIS3Q99687 375 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.44□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HMMRO75330 724 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRIM37O94972 964 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP44Q9H0E7 712 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADCY9O60503 1353 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RGS12O14924 1447 aa8.43□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A0A087WZG4 1122 aa8.42□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.42□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KCNQ4P56696 695 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms