RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STARD3NLO95772 234 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RFC4P35249 363 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYT17Q9BSW7 474 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM35Q9UPQ4 493 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GYS1P13807 737 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMOD3Q0VAK6 560 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRS2Q9HD23 443 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C4AP0C0L4 1744 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP16Q9Y5T5 823 aa32.87■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CANXP27824 592 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM3BQ7LBC6 1761 aa32.85■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APAF1O14727 1248 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A1BGP04217 495 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL15A1P39059 1388 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF5P55010 431 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLGN1Q8N2Q7 840 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLHL34Q8N239 644 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP10P09238 476 aa32.81■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FKBP8Q14318 412 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPYL4Q9UJ04 414 aa32.79■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USPL1Q5W0Q7 1092 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLGN2Q8NFZ4 835 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NARFQ9UHQ1 456 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BABAM1Q9NWV8 329 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZPR1O75312 459 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHL1O00533 1208 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF26B4DH59 902 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF15Q8N660 670 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD2APQ9Y5K6 639 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A087WZG4 1122 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDR1Q08345 913 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TM4SF1P30408 202 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PARP3Q9Y6F1 533 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMB4A4D0S4 1761 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UTRNP46939 3433 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFIXQ14938 502 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP44Q96MT7 982 aa32.66■■■□□ 2.82
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAMTA2O94983 1202 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF853P0CG23 659 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT24Q2M2I5 525 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C10orf71Q711Q0 1435 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCN7AQ01118 1682 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MBIPQ9NS73 344 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC27Q2M243 656 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFT57Q9NWB7 429 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WWC1Q8IX03 1113 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF13BQ9NQT8 1826 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYL6BP14649 208 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNAI1P63096 354 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDIA6Q15084 440 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NGEFQ8N5V2 710 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PXDNLA1KZ92 1463 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR162Q16538 588 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCORQ6W2J9 1755 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERBB4Q15303 1308 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERPINB2P05120 415 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TGFB2P61812 414 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PROSER3Q2NL68 480 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NECTIN2Q92692 538 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTLL7Q6ZT98 887 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0G2JLW4 131 aa32.51■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLEC4GQ6UXB4 293 aa32.51■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.51■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANXA1P04083 346 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HLFQ16534 295 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WWC3Q9ULE0 1092 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPEP1P16444 411 aa32.49■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUSP27Q5VZP5 1158 aa32.49■■■□□ 2.79
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