RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
PDSS1-201ENST00000376215 C4BP0C0L5 1744 aa30.38■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 NECTIN2Q92692 538 aa30.38■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.38■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.36■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 STARD3NLO95772 234 aa30.35■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 A1BGP04217 495 aa30.33■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 CRKLP46109 303 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 CACNA1FO60840 1977 aa30.33■■■□□ 2.45
PDSS1-201ENST00000376215 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa30.31■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 NBPF26B4DH59 902 aa30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 PDIA6Q15084 440 aa30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 NBPF14Q5TI25 921 aa30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 NBPF15Q8N660 670 aa30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.3■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 UBR3Q6ZT12 1888 aa30.29■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 PROSER3Q2NL68 480 aa30.29■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC87Q9NVE4 849 aa30.29■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa30.29■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 ANXA1P04083 346 aa30.28■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF428Q96B54 188 aa30.28■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa30.27■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.27■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 ERBB4Q15303 1308 aa30.27■■■□□ 2.44
PDSS1-201ENST00000376215 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF827Q17R98 1081 aa30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.25■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 MYL6BP14649 208 aa30.24■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.24■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 AKT1S1Q96B36 256 aa30.24■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 STK31Q9BXU1 1019 aa30.24■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 GNPATO15228 680 aa30.22■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 SLC4A2P04920 1241 aa30.22■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 AK7Q96M32 723 aa30.22■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.22■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 SMIM5Q71RC9 77 aa30.21■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.21■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 BCAR3O75815 825 aa30.2■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 EIF5P55010 431 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
PDSS1-201ENST00000376215 RPS6KA4O75676 772 aa30.19■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 G2E3Q7L622 706 aa30.19■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 C4AP0C0L4 1744 aa30.19■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 HYPKQ9NX55 129 aa30.18■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 QSER1Q2KHR3 1735 aa30.17■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 COL15A1P39059 1388 aa30.16■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.15■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 SLC15A2Q16348 729 aa30.14■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.14■■■□□ 2.42
PDSS1-201ENST00000376215 PHF14O94880 888 aa30.14■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 COPS6Q7L5N1 327 aa30.14■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 STK32BQ9NY57 414 aa30.14■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 FLIIQ13045 1269 aa30.13■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.13■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 SSFA2P28290 1259 aa30.11■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 BCORQ6W2J9 1755 aa30.11■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 SOCS7O14512 581 aa30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 ADRA2BP18089 450 aa30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 TRAPPC3LQ5T215 181 aa30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.09■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 SCN7AQ01118 1682 aa30.08■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PDSS1-201ENST00000376215 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 KIF16BQ96L93 1317 aa30.07■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 NUP98P52948 1817 aa30.07■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 ARXQ96QS3 562 aa30.07■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 A0A087WZG4 1122 aa30.06■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 ADCY9O60503 1353 aa30.06■■■□□ 2.4
PDSS1-201ENST00000376215 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms