RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 RGS12O14924 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 FLIIQ13045 1269 aa22.64■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.64■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.64■■□□□ 1.22
LTV1-201ENST00000367576 MS4A1P11836 297 aa22.64■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.64■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.63■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 PTPRCP08575 1304 aa22.62■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.62■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 ABCC4O15439 1325 aa22.62■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 F6X3S4 739 aa22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 MYL6BP14649 208 aa22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.6■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 NHSQ6T4R5 1651 aa22.6■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 PDIA6Q15084 440 aa22.59■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.59■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.59■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 PALLDQ8WX93 1383 aa22.58■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 RXRBP28702 533 aa22.58■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.58■■□□□ 1.21
LTV1-201ENST00000367576 POTEAQ6S8J7 498 aa22.57■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 A1BGP04217 495 aa22.57■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 TJP1Q07157 1748 aa22.56■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.56■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 HYPKQ9NX55 129 aa22.56■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.55■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 BTAF1O14981 1849 aa22.55■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 CACNA1FO60840 1977 aa22.55■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 NBPF26B4DH59 902 aa22.54■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 NBPF14Q5TI25 921 aa22.54■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 NBPF15Q8N660 670 aa22.54■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.54■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.54■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 SBF2Q86WG5 1849 aa22.53■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 ADCY9O60503 1353 aa22.52■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.52■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.52■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 SIK1P57059 783 aa22.52■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.52■■□□□ 1.2
LTV1-201ENST00000367576 ATP6V1AP38606 617 aa22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 COPS6Q7L5N1 327 aa22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ERBB4Q15303 1308 aa22.51■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 STARD3NLO95772 234 aa22.5■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 KCNQ4P56696 695 aa22.5■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ITPK1Q13572 414 aa22.5■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.5■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.5■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.49■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.48■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 TRIM37O94972 964 aa22.47■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 KSR2Q6VAB6 950 aa22.47■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.47■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.46■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.45■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.45■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.45■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.45■■□□□ 1.19
LTV1-201ENST00000367576 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 MEIS3Q99687 375 aa22.45■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 BEND3Q5T5X7 828 aa22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 ARXQ96QS3 562 aa22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.43■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.42■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.42■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 AAMPQ13685 434 aa22.41■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 MYD88Q99836 296 aa22.41■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
LTV1-201ENST00000367576 ATP10DQ9P241 1426 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms