RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.7■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.69■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 NEUROD2Q15784 382 aa19.69■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 SYT17Q9BSW7 474 aa19.68■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 GYS1P13807 737 aa19.67■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 RFC4P35249 363 aa19.67■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 KLHL34Q8N239 644 aa19.67■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 COL15A1P39059 1388 aa19.67■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 STARD3NLO95772 234 aa19.66■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.66■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 USP16Q9Y5T5 823 aa19.66■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.65■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 MRS2Q9HD23 443 aa19.65■□□□□ 0.74
CSAG1-201ENST00000361211 A1BGP04217 495 aa19.64■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 APAF1O14727 1248 aa19.63■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 MMP10P09238 476 aa19.63■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.63■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.62■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.62■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.62■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 FKBP8Q14318 412 aa19.61■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.61■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.6■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.59■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 NARFQ9UHQ1 456 aa19.59■□□□□ 0.73
CSAG1-201ENST00000361211 ZPR1O75312 459 aa19.58■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 SCN7AQ01118 1682 aa19.58■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF26B4DH59 902 aa19.57■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 DDR1Q08345 913 aa19.57■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF15Q8N660 670 aa19.57■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.56■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.56■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.56■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WZG4 1122 aa19.55■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CHL1O00533 1208 aa19.55■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.55■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.55■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 TM4SF1P30408 202 aa19.54■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 KRT24Q2M2I5 525 aa19.54■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 BCORQ6W2J9 1755 aa19.54■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CAMTA2O94983 1202 aa19.53■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 NFIXQ14938 502 aa19.53■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.53■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.53■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP44Q96MT7 982 aa19.51■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF853P0CG23 659 aa19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 MBIPQ9NS73 344 aa19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.49■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.49■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.48■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 MYL6BP14649 208 aa19.48■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.48■□□□□ 0.713e-7■■■■□ 26.4
CSAG1-201ENST00000361211 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 NGEFQ8N5V2 710 aa19.48■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 IFT57Q9NWB7 429 aa19.48■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 GPR162Q16538 588 aa19.47■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 NECTIN2Q92692 538 aa19.47■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 UTRNP46939 3433 aa19.47■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ANXA1P04083 346 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINB2P05120 415 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PDIA6Q15084 440 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC27Q2M243 656 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 PROSER3Q2NL68 480 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ERBB4Q15303 1308 aa19.46■□□□□ 0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 GNAI1P63096 354 aa19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 HLFQ16534 295 aa19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 WWC1Q8IX03 1113 aa19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0G2JLW4 131 aa19.44■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 DPEP1P16444 411 aa19.44■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TGFB2P61812 414 aa19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms