RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 REC8O95072 547 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 SSFA2P28290 1259 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-201ENST00000357436 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 GNAI3P08754 354 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 AK9Q5TCS8 1911 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.01■■□□□ 1.27
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SH3BP1-201ENST00000357436 STRCQ7RTU9 1775 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 ERC2O15083 957 aa23■■□□□ 1.27
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SH3BP1-201ENST00000357436 ATP8B2P98198 1209 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.99■■□□□ 1.27
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SH3BP1-201ENST00000357436 MYL6BP14649 208 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1-201ENST00000357436 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3BP1-201ENST00000357436 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP1-201ENST00000357436 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.93■■□□□ 1.26
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SH3BP1-201ENST00000357436 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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SH3BP1-201ENST00000357436 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-201ENST00000357436 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF790Q6PG37 636 aa22.91■■□□□ 1.26
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SH3BP1-201ENST00000357436 SPG7Q9UQ90 795 aa22.91■■□□□ 1.26
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SH3BP1-201ENST00000357436 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.89■■□□□ 1.26
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SH3BP1-201ENST00000357436 NCAPD2Q15021 1401 aa22.88■■□□□ 1.25
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SH3BP1-201ENST00000357436 PKP1Q13835 747 aa22.87■■□□□ 1.25
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SH3BP1-201ENST00000357436 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 ADCY9O60503 1353 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP1-201ENST00000357436 AOX1Q06278 1338 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP1-201ENST00000357436 MCTP1Q6DN14 999 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.83■■□□□ 1.25
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SH3BP1-201ENST00000357436 POLA2Q14181 598 aa22.83■■□□□ 1.25
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SH3BP1-201ENST00000357436 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1-201ENST00000357436 ANAPC15P60006 121 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 BTG4Q9NY30 223 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 COL18A1P39060 1754 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB11FIP3O75154 756 aa22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP1-201ENST00000357436 MCM2P49736 904 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.82■■□□□ 1.24
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