RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 EVI5LQ96CN4 794 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 TOM1O60784 492 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP57L1Q8IYX8 460 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX11Q96FC9 970 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX35Q5T0J7 233 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCA1Q86XH1 822 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 CAGE1Q8TC20 777 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 MCM4P33991 863 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 AK7Q96M32 723 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF213O14771 459 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 PPFIBP1Q86W92 1011 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC83Q8IWF9 413 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF76P36508 570 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 HSP90B2PQ58FF3 399 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.14■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR62O43379 1518 aa19.14■□□□□ 0.66
SH3BP4-201ENST00000344528 CBFA2T2O43439 604 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 FBLN1P23142 703 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 FLT4P35916 1363 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 LDHCP07864 332 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCC2Q92887 1545 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO6Q9UM54 1294 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 POLKQ9UBT6 870 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 TXLNBQ8N3L3 684 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 FERMT3Q86UX7 667 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf229H3BNL8 230 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX22Q9Y458 520 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 NPATQ14207 1427 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH1L1O75891 902 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf76Q96K31 380 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLIM4O00461 696 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA1P04083 346 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 RFC4P35249 363 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 SPC24Q8NBT2 197 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYM3Q14202 1370 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPKBP1O60336 1514 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 TESK2Q96S53 571 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 DEF6Q9H4E7 631 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 SMTNL1A8MU46 457 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K11Q16584 847 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 IL27Q8NEV9 243 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4-201ENST00000344528 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 BAG3O95817 575 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 COPS6Q7L5N1 327 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPM2O94759 1503 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 TNIP1Q15025 636 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 KSR2Q6VAB6 950 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 NBPF4Q96M43 638 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4-201ENST00000344528 HMG20BQ9P0W2 317 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms