RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 RAI14Q9P0K7 980 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRO-201ENST00000281171 HSF2BPO75031 334 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRO-201ENST00000281171 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-201ENST00000281171 ZNF853P0CG23 659 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-201ENST00000281171 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-201ENST00000281171 CABP1Q9NZU7 370 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-201ENST00000281171 TCHPQ9BT92 498 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 MYZAPP0CAP1 466 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC6Q16204 474 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD62A6NC57 917 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF165P49910 485 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PPP2R5AQ15172 486 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PAFAH1B1P43034 410 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 CABP4P57796 275 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-201ENST00000281171 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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