RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 MMP10P09238 476 aa40.46■■■■■ 4.07
INO80B-201ENST00000233331 NLGN2Q8NFZ4 835 aa40.46■■■■■ 4.07
INO80B-201ENST00000233331 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
INO80B-201ENST00000233331 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.45■■■■■ 4.07
INO80B-201ENST00000233331 COL15A1P39059 1388 aa40.45■■■■■ 4.07
INO80B-201ENST00000233331 CANXP27824 592 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 RIPK4P57078 832 aa40.44■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 TMPOP42166 694 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 RUNDC1Q96C34 613 aa40.42■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 MIS18AQ9NYP9 233 aa40.42■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 CD2APQ9Y5K6 639 aa40.4■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 KDM3BQ7LBC6 1761 aa40.38■■■■■ 4.06
INO80B-201ENST00000233331 ZPR1O75312 459 aa40.38■■■■■ 4.05
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INO80B-201ENST00000233331 LMOD3Q0VAK6 560 aa40.37■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa40.36■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 FKBP8Q14318 412 aa40.36■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 USPL1Q5W0Q7 1092 aa40.36■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 NEUROD2Q15784 382 aa40.35■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 ANP32CO43423 234 aa40.34■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 NARFQ9UHQ1 456 aa40.34■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 USP16Q9Y5T5 823 aa40.34■■■■■ 4.05
INO80B-201ENST00000233331 A1BGP04217 495 aa40.33■■■■■ 4.05
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
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INO80B-201ENST00000233331 GPR162Q16538 588 aa40.31■■■■■ 4.04
INO80B-201ENST00000233331 A0A087WZG4 1122 aa40.3■■■■■ 4.04
INO80B-201ENST00000233331 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
INO80B-201ENST00000233331 CCDC184Q52MB2 194 aa40.29■■■■■ 4.04
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INO80B-201ENST00000233331 LAMB4A4D0S4 1761 aa40.27■■■■■ 4.04
INO80B-201ENST00000233331 TSPYL4Q9UJ04 414 aa40.26■■■■■ 4.04
INO80B-201ENST00000233331 C10orf71Q711Q0 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
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INO80B-201ENST00000233331 DDR1Q08345 913 aa40.25■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 BCL2L12Q9HB09 334 aa40.24■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 KIF13BQ9NQT8 1826 aa40.23■■■■■ 4.03
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INO80B-201ENST00000233331 SCN7AQ01118 1682 aa40.23■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa40.22■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 TM4SF1P30408 202 aa40.21■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
INO80B-201ENST00000233331 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 NFIXQ14938 502 aa40.19■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 MRS2Q9HD23 443 aa40.18■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 BABAM1Q9NWV8 329 aa40.18■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 APAF1O14727 1248 aa40.17■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP40.17■■■■■ 4.02
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INO80B-201ENST00000233331 YY1P25490 414 aa40.15■■■■■ 4.02
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INO80B-201ENST00000233331 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa40.14■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 BCORQ6W2J9 1755 aa40.13■■■■■ 4.02
INO80B-201ENST00000233331 BICDL1Q6ZP65 573 aa40.13■■■■■ 4.01
INO80B-201ENST00000233331 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
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INO80B-201ENST00000233331 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
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INO80B-201ENST00000233331 GRIN3BO60391 1043 aa40.09■■■■■ 4.01
INO80B-201ENST00000233331 CHL1O00533 1208 aa40.08■■■■■ 4.01
INO80B-201ENST00000233331 SERPINB2P05120 415 aa40.08■■■■■ 4.01
INO80B-201ENST00000233331 NRXN2Q9P2S2 1712 aa40.08■■■■■ 4.01
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INO80B-201ENST00000233331 CHD4Q14839 1912 aa40.06■■■■■ 4
INO80B-201ENST00000233331 DPEP1P16444 411 aa40.06■■■■■ 4
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF652Q9Y2D9 606 aa40.01■■■■■ 4
INO80B-201ENST00000233331 ERBB4Q15303 1308 aa40■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 CFAP44Q96MT7 982 aa40■■■■□ 3.99
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INO80B-201ENST00000233331 KRT24Q2M2I5 525 aa39.98■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 CLEC4GQ6UXB4 293 aa39.98■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa39.96■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 CHRNA5P30532 468 aa39.96■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 BCS1LQ9Y276 419 aa39.96■■■■□ 3.99
INO80B-201ENST00000233331 KCNA3P22001 575 aa39.94■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 MBIPQ9NS73 344 aa39.94■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 IFT57Q9NWB7 429 aa39.94■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 RGL2O15211 777 aa39.93■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 KIF6Q6ZMV9 814 aa39.93■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 NECTIN2Q92692 538 aa39.93■■■■□ 3.98
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