RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.11■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TIE1P35590 1138 aa23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 PSEN1P49768 467 aa23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 AK7Q96M32 723 aa23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 DCBLD2Q96PD2 775 aa23.1■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ITPK1Q13572 414 aa23.09■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ARXQ96QS3 562 aa23.09■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.08■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.08■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NUDCQ9Y266 331 aa23.08■■□□□ 1.29
PLGRKT-201ENST00000223864 POLD1P28340 1107 aa23.07■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.06■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 LGR6Q9HBX8 967 aa23.06■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 MRC1P22897 1456 aa23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 SYT17Q9BSW7 474 aa23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.05■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 SSFA2P28290 1259 aa23.03■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.03■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.03■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K5Q99683 1374 aa23.02■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.02■■□□□ 1.28
PLGRKT-201ENST00000223864 GNPATO15228 680 aa23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 PHF14O94880 888 aa23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 PRKAR2BP31323 418 aa23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 TJP1Q07157 1748 aa23.01■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 FCHSD2O94868 740 aa22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 MSL1Q68DK7 614 aa22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 SMIM5Q71RC9 77 aa22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.99■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.98■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 IL17REQ8NFR9 667 aa22.96■■□□□ 1.27
PLGRKT-201ENST00000223864 RALBP1Q15311 655 aa22.95■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 RPS6KA4O75676 772 aa22.94■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC39A6Q13433 755 aa22.94■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.94■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.94■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 C4AP0C0L4 1744 aa22.94■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.93■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 TEFQ10587 303 aa22.93■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.92■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.91■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.9■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 CHD4Q14839 1912 aa22.9■■□□□ 1.26
PLGRKT-201ENST00000223864 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.89■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 RFC4P35249 363 aa22.88■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.88■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.87■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.87■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.87■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 NEFMP07197 916 aa22.86■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF790Q6PG37 636 aa22.86■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.86■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 MMP10P09238 476 aa22.83■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 GYS1P13807 737 aa22.83■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.83■■□□□ 1.25
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.82■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.82■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 BTBD11A6QL63 1104 aa22.82■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR162Q16538 588 aa22.82■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 MCM10Q7L590 875 aa22.82■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 STK25O00506 426 aa22.81■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 STARD3NLO95772 234 aa22.81■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 YY1P25490 414 aa22.8■■□□□ 1.24
PLGRKT-201ENST00000223864 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms