RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219054.10

ACSM2A-201, Transcript of acyl-CoA synthetase medium chain family member 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSM2A, Length 1,988 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2A-201ENST00000219054 PDIA6Q15084 440 aa22.91■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.91■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.9■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.9■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.9■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.9■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.89■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 BTG4Q9NY30 223 aa22.89■■□□□ 1.26
ACSM2A-201ENST00000219054 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.89■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 ALDH1L1O75891 902 aa22.88■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 APBB1O00213 710 aa22.86■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 USP16Q9Y5T5 823 aa22.86■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 SSH3Q8TE77 659 aa22.85■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.85■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 TTC22Q5TAA0 569 aa22.84■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.84■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 GLI3P10071 1580 aa22.84■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 LINS1Q8NG48 757 aa22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 USP35Q9P2H5 1018 aa22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.83■■□□□ 1.25
ACSM2A-201ENST00000219054 MYL6BP14649 208 aa22.83■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.83■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 POLA2Q14181 598 aa22.82■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.82■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.82■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 PAPPAQ13219 1627 aa22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 BCL11AQ9H165 835 aa22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 COPS6Q7L5N1 327 aa22.8■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.8■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 PHLPP1O60346 1717 aa22.8■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 CDC45O75419 566 aa22.79■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.79■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 SRGAP3O43295 1099 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 MTX1Q13505 466 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 DISP2A7MBM2 1401 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 UTYO14607 1347 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 ERBB4Q15303 1308 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 RAB11FIP3O75154 756 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.77■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 GRM8O00222 908 aa22.77■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 SLC4A3P48751 1232 aa22.77■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.77■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.77■■□□□ 1.24
ACSM2A-201ENST00000219054 PDE1AP54750 535 aa22.76■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.76■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 TNS2Q63HR2 1409 aa22.76■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 IGKV5-2P06315 115 aa22.75■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 BECN1Q14457 450 aa22.75■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.74■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 SDSP20132 328 aa22.74■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.73■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 TOM1O60784 492 aa22.73■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.73■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 MYD88Q99836 296 aa22.72■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.72■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.71■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 MX1P20591 662 aa22.71■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 GCKRQ14397 625 aa22.71■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.71■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 NBPF26B4DH59 902 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 NBPF14Q5TI25 921 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 NBPF15Q8N660 670 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 STAP2Q9UGK3 403 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 ITGB4P16144 1822 aa22.7■■□□□ 1.23
ACSM2A-201ENST00000219054 SUCLG2Q96I99 432 aa22.7■■□□□ 1.22
ACSM2A-201ENST00000219054 EXOC5O00471 708 aa22.69■■□□□ 1.22
ACSM2A-201ENST00000219054 KAZALD1Q96I82 304 aa22.69■■□□□ 1.22
ACSM2A-201ENST00000219054 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms