RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTA-201ENST00000216840 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 KSR2Q6VAB6 950 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 GLI3P10071 1580 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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RABGGTA-201ENST00000216840 BTG4Q9NY30 223 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-201ENST00000216840 ALDH1L1O75891 902 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 USP16Q9Y5T5 823 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-201ENST00000216840 PAPPAQ13219 1627 aa21.39■■□□□ 1.01
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RABGGTA-201ENST00000216840 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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RABGGTA-201ENST00000216840 SSH3Q8TE77 659 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 BCL11AQ9H165 835 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTA-201ENST00000216840 USP35Q9P2H5 1018 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 POLA2Q14181 598 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.36■■□□□ 1.01
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RABGGTA-201ENST00000216840 SLC4A3P48751 1232 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 LINS1Q8NG48 757 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 COPS6Q7L5N1 327 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-201ENST00000216840 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
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RABGGTA-201ENST00000216840 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.33■■□□□ 1
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RABGGTA-201ENST00000216840 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.33■■□□□ 1
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RABGGTA-201ENST00000216840 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE1AP54750 535 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 MTX1Q13505 466 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 GRM8O00222 908 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB11FIP3O75154 756 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 ERBB4Q15303 1308 aa21.29■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.29■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 ITGB4P16144 1822 aa21.29■■□□□ 1
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RABGGTA-201ENST00000216840 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.28■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.27■■□□□ 1
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF26B4DH59 902 aa21.27■■□□□ 1
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RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF14Q5TI25 921 aa21.27■■□□□ 1
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RABGGTA-201ENST00000216840 MYD88Q99836 296 aa21.27■□□□□ 0.99
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RABGGTA-201ENST00000216840 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGGTA-201ENST00000216840 STAP2Q9UGK3 403 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGGTA-201ENST00000216840 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS2O95450 1211 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-201ENST00000216840 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.24■□□□□ 0.99
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