RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Smarcc1P97496 1104 aa38.95■■■■□ 3.83
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Irf9Q61179 399 aa38.92■■■■□ 3.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Slfnl1Q8BHW9 410 aa38.89■■■■□ 3.82
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Znf521Q6KAS7 1311 aa38.8■■■■□ 3.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Exoc6bA6H5Z3 810 aa38.8■■■■□ 3.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa38.77■■■■□ 3.8
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 MvpQ9EQK5 861 aa38.76■■■■□ 3.8
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ddx60E9PZQ1 1711 aa38.75■■■■□ 3.79
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adam1aQ60813 791 aa38.65■■■■□ 3.78
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Atp1b3P97370 278 aa38.62■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa38.62■■■■□ 3.77
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa38.62■■■■□ 3.77
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ddx58Q6Q899 926 aa38.6■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AK157302I3ITR1 129 aa38.59■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Isca1Q9D924 129 aa38.59■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Map3k13Q1HKZ5 959 aa38.58■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Slf2Q6P9P0 1278 aa38.58■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa38.57■■■■□ 3.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa38.57■■■■□ 3.76
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ripor2Q80U16 1078 aa38.53■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sumf1Q8R0F3 372 aa38.53■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Col11a2Q64739 1736 aa38.53■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NmiO35309 314 aa38.52■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Spata31d1bE9QA57 1361 aa38.52■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SowahdQ8BY98 327 aa38.52■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mrc1Q61830 1456 aa38.51■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prkar2bP31324 416 aa38.51■■■■□ 3.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myd88P22366 296 aa38.5■■■■□ 3.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Amhr2Q8K592 568 aa38.5■■■■□ 3.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif23E9Q5G3 953 aa38.49■■■■□ 3.75
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NppbP40753 121 aa38.49■■■■□ 3.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Soga3Q6NZL0 945 aa38.49■■■■□ 3.75
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Grm8P47743 908 aa38.47■■■■□ 3.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Akt1s1Q9D1F4 257 aa38.47■■■■□ 3.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cwc25Q9DBF7 416 aa38.46■■■■□ 3.75
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Stk36Q69ZM6 1316 aa38.44■■■■□ 3.74
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