RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ankrd1Q9CR42 319 aa24.18■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 DmtnQ9WV69 405 aa24.18■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa24.17■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Txndc16Q7TN22 820 aa24.17■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Aplp1Q03157 653 aa24.17■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bicdl1A0JNT9 577 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Znf653Q6YND2 615 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccne1Q61457 408 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Exoc8Q6PGF7 716 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 LarsQ8BMJ2 1178 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrfip2Q91WK0 415 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Grin2aP35436 1464 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atf7Q8R0S1 413 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nap1l5Q9JJF0 156 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rad23bP54728 416 aa24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 LyarQ08288 388 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Uspl1Q3ULM6 1089 aa24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sass6Q80UK7 654 aa24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bin1O08539 588 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 PaskQ8CEE6 1383 aa24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cep120Q7TSG1 988 aa24.15■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Syde2-201ENSMUST00000039517 EappQ5BU09 281 aa24.14■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slx4Q6P1D7 1565 aa24.14■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Smc1bQ920F6 1248 aa24.14■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tsg101Q61187 391 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm18336A0A140LIU8 765 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Wdhd1P59328 1117 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Irf9Q61179 399 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pde1cQ64338 706 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Chpf2Q3UU43 768 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmem87bQ8BKU8 555 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fbf1A2A870 1173 aa24.12■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nucb2P81117 420 aa24.12■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cep135Q6P5D4 1140 aa24.12■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Soga3Q6NZL0 945 aa24.12■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slc5a1Q8C3K6 665 aa24.12■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 GnpatP98192 678 aa24.12■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mcm10Q0VBD2 885 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dmrt2Q8BG36 561 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Usp25P57080 1055 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mtmr3Q8K296 1196 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf34Q99KR6 376 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 TimelessQ9R1X4 1197 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vps37dQ810I0 261 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Smtnl1Q99LM3 459 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hmg20bQ9Z104 317 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc93Q7TQK5 629 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Serpina10Q8R121 448 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sdc2P43407 202 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Erlin1Q91X78 346 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 IncenpQ9WU62 880 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nkx1-2P42580 305 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Map3k2Q61083 619 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ampd3O08739 766 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 MycnP03966 462 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kcnj4P52189 445 aa24.09■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Stat1P42225 749 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Idi2Q8BFZ6 227 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf41Q8BH75 317 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc155Q80VJ8 648 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ankrd26Q811D2 1581 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slc7a3P70423 618 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atp10dQ8K2X1 1416 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 BbxQ8VBW5 907 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trim27Q62158 513 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Znf287Q9EQB9 759 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Camsap2Q8C1B1 1461 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ripk4Q9ERK0 786 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cfap73J3QPZ5 306 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Jmjd4Q8BFT6 427 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Srgap1Q91Z69 1062 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zscan29E9Q5B4 869 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 LifrP42703 1092 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gnat3Q3V3I2 354 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Klc3Q91W40 508 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm10093D3YYI8 482 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Traf3ip1Q149C2 625 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zbtb21E9Q444 1094 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 AI481877A2ALV5 1481 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Map2k1P31938 393 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vps18Q8R307 973 aa24.04■■□□□ 1.44
Syde2-201ENSMUST00000039517 FanclQ9CR14 375 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms