RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 P2rx7Q9Z1M0 595 aa25.8■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ambra1A2AH22 1300 aa25.8■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa25.8■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf428Q8C1M2 176 aa25.79■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 PigbQ9JJQ0 542 aa25.79■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa25.78■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 PdgfdQ925I7 370 aa25.78■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 PalmQ9Z0P4 383 aa25.78■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp19Q3UJD6 1360 aa25.78■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp777B9EKF4 885 aa25.77■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dpf1Q9QX66 387 aa25.77■■□□□ 1.72
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Ltb-201ENSMUST00000025262 MetP16056 1379 aa25.75■■□□□ 1.71
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa25.72■■□□□ 1.71
Ltb-201ENSMUST00000025262 Micall1Q8BGT6 870 aa25.7■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prr5lA2AVJ5 370 aa25.69■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arid3aQ62431 601 aa25.69■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam83gQ5SWY7 812 aa25.68■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdca7Q9D0M2 382 aa25.68■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snai1Q02085 264 aa25.67■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa25.67■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa25.66■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col4a1P02463 1669 aa25.66■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa25.65■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mylk2Q8VCR8 613 aa25.65■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc4a9E9PUP3 929 aa25.64■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stk31Q99MW1 1018 aa25.64■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa25.64■■□□□ 1.7
Ltb-201ENSMUST00000025262 VegfbP49766 207 aa25.63■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp48Q3V0C5 1052 aa25.63■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm12185Q5NCB2 835 aa25.63■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptf1aQ9QX98 324 aa25.63■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp646Q6NV66 1788 aa25.63■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr247E9PVJ7 320 aa25.62■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr819K7N727 320 aa25.62■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 ClspnQ80YR7 1315 aa25.62■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abcc12Q80WJ6 1366 aa25.61■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Esco1Q69Z69 843 aa25.59■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa25.59■■□□□ 1.69
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrc1Q61830 1456 aa25.56■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa25.56■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 St5Q924W7 1134 aa25.56■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cabp2Q9JLK4 216 aa25.56■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slf2Q6P9P0 1278 aa25.55■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btbd11Q6GQW0 1109 aa25.54■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col26a1Q91VF6 440 aa25.54■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ddx60E9PZQ1 1711 aa25.54■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa25.53■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nlgn2Q69ZK9 836 aa25.53■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Soga3Q6NZL0 945 aa25.53■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Glis2Q8VDL9 521 aa25.53■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp831A2ADM8 1628 aa25.52■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Irx6Q9ER75 438 aa25.52■■□□□ 1.68
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnnm1Q0GA42 951 aa25.5■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 SowahdQ8BY98 327 aa25.5■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plagl1Q9JLQ4 704 aa25.5■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa25.49■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Magea8O89012 320 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Csf1rP09581 977 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifit1bl2Q3U687 466 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vil1Q62468 827 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plekhg5Q66T02 1073 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tsen2Q6P7W5 460 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prkab2Q6PAM0 271 aa25.47■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcdc2bF7BCK0 340 aa25.46■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Flad1Q8R123 492 aa25.46■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nup188Q6ZQH8 1759 aa25.46■■□□□ 1.67
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stox1B2RQL2 990 aa25.45■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrch1P62046 709 aa25.45■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dok7Q18PE0 504 aa25.45■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dbndd1Q9CZ00 160 aa25.45■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lama4P97927 1816 aa25.44■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prr29B1ARI9 187 aa25.44■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 CltaO08585 235 aa25.44■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fstl1Q62356 306 aa25.44■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Flt1P35969 1333 aa25.43■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp34Q6ZQ93 3582 aa25.43■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map3k9Q3U1V8 1077 aa25.43■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scn9aQ62205 1984 aa25.42■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc39a6Q8C145 765 aa25.42■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc5Q99LG4 440 aa25.42■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Iqsec3Q3TES0 1195 aa25.41■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 TefQ9JLC6 301 aa25.41■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa25.41■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cers3Q1A3B0 383 aa25.4■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp2b4Q6Q477 1205 aa25.4■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Duox1A2AQ92 1551 aa25.39■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Ltb-201ENSMUST00000025262 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
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