RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 THAP4Q8WY91 577 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ESAMQ96AP7 390 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 URADA6NGE7 173 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 NKX2-8O15522 239 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 AGTR2P50052 363 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SKP1P63208 163 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 RGS1Q08116 209 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 DSG2Q14126 1118 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 MLIPQ5VWP3 458 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF740Q8NDX6 193 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 UBE2E3Q969T4 207 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 IP6K3Q96PC2 410 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 CACNA1GO43497 2377 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ERVH48-1M5A8F1 160 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 FOXS1O43638 330 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 UGDHO60701 494 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 WFS1O76024 890 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 MED26O95402 600 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SERPINA6P08185 405 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 KRT15P19012 456 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 EPORP19235 508 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 AVPR1BP47901 424 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 IRF8Q02556 426 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SSPNQ14714 243 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 XKR6Q5GH73 641 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 COX15Q7KZN9 410 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 RUFY1Q96T51 708 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 POLHQ9Y253 713 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ASB1Q9Y576 335 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.16■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 GLRA3O75311 464 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 PYGBP11216 843 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 TAC1P20366 129 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SLCO1A2P46721 670 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 NFKB2Q00653 900 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 CHIT1Q13231 466 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 DOC2AQ14183 400 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 HERC3Q15034 1050 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 TTC9Q92623 222 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 COL26A1Q96A83 441 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 RHBGQ9H310 441 aa22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SUMO3-205ENST00000466861 TK2O00142 265 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 NDUFS4O43181 175 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PRAMEF4O60810 478 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CLEC3AO75596 197 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SERPINB1P30740 379 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 HNF4AP41235 474 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 FOLR3P41439 243 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 OR1D4P47884 311 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CCT5P48643 541 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 OCA2Q04671 838 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ERV3-1Q14264 604 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 NKG7Q16617 165 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 LIPJQ5W064 366 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 C16orf46Q6P387 395 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 RAB43Q86YS6 212 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TEX9Q8N6V9 391 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TGIF2Q9GZN2 237 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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