RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS33BQ9H267 617 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF121Q9H920 327 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PELI2Q9HAT8 420 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PANK4Q9NVE7 773 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNNQ9UQP3 1299 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1B0GWJ7 208 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H3BMM5 538 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 M0R296 226 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E2F3O00716 465 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC28A2O43868 658 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPN1MWP04001 364 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT6BP04259 564 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F3P13726 295 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRF1P14222 555 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMA5P28066 241 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFTPDP35247 375 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLIPR1P48060 266 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFX2P48378 723 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT6CP48668 564 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MLLT10P55197 1068 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BNC1Q01954 994 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH18Q13634 790 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CALCRLQ16602 461 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRNP1Q6NT89 227 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM171BQ6P995 826 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM219Q86XT9 240 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC5A11Q8WWX8 675 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSX3Q99909 188 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF416Q9BWM5 594 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MALT1Q9UDY8 824 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIX4Q9UIU6 781 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KDRP35968 1356 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM89A2RUT3 159 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANTXRLA6NF34 631 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C4orf47A7E2U8 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBXN8O00124 270 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF197O14709 1029 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IKBKBO14920 756 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHUKO15111 745 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRID2O43424 1007 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNJ13O60928 360 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PALMO75781 387 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PROS1P07225 676 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC00271P0C7V0 271 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZCCHC18P0CG32 403 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPB41P11171 864 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CETPP11597 493 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH3P22223 829 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLA-FP30511 346 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRD5A2P31213 254 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AHRP35869 848 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SULT1E1P49888 294 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNK10P57789 538 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCZ1BP86790 482 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.55□□□□□ -1.68
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