RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7BY64 318 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH17O14917 1159 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RX6O15547 441 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR35P0CG20 571 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FDXRP22570 491 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNTAP49354 379 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTK6Q13882 451 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM53BQ14153 422 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFA9Q16795 377 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAAH2Q6GMR7 532 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAP1Q96NZ9 151 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.86■■□□□ 1.57
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPEQ02224 2701 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOTCH2Q04721 2471 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa24.85■■□□□ 1.57
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AVPR1BP47901 424 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT16Q17RD7 645 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT3A1Q6NUS8 523 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCOLN3Q8TDD5 553 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAR1Q8WVX9 515 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGFRNQ9P2B2 879 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGAM1P18669 254 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARG2P78540 354 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R7Q15435 360 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1N1Q8NGS0 311 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMF1Q92530 271 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKL2Q9ULH7 1088 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYTNA2CJ06 578 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E2F3O00716 465 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP10O95393 424 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STATHP02808 62 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRHP07919 91 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDN3P14138 238 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX11P35716 441 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS4P49798 205 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBPL1P62380 186 aa24.83■■□□□ 1.57
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYMQ14894 314 aa24.83■■□□□ 1.57
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIRT6Q8N6T7 355 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC138Q96M89 665 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDNQ99608 321 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF700Q9H0M5 742 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCBD2Q9H0N5 130 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLEQ07864 2286 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFS1O76024 890 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN1O95832 211 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8GP07360 202 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PALM2Q8IXS6 379 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35F6Q8N357 371 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR9A4Q8NGU2 314 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE10AQ9Y233 779 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YIG0 161 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC4O95801 387 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP2B1P63010 937 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCOLCEQ15113 449 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM205Q6UW68 189 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VN1R4Q7Z5H5 301 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP11Q96EK4 314 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARVBQ9HBI1 364 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSA2O95478 260 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELA2AP08217 269 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf89P0DMQ9 161 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICAM2P13598 275 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSNK1G2P78368 415 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP140Q13342 867 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGTRAPQ6RW13 159 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf64Q86WR6 236 aa24.8■■□□□ 1.56
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