RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 A6NL46 340 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 VPS26AO75436 327 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 TTC4O95801 387 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 ALPPP05187 535 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 UMODP07911 640 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 ITGAXP20702 1163 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 MCM3P25205 808 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 PNLIPRP1P54315 467 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 MLLT10P55197 1068 aa25.53■■□□□ 1.68
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ODC1-204ENST00000446285 COLEC12Q5KU26 742 aa25.53■■□□□ 1.68
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ODC1-204ENST00000446285 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.53■■□□□ 1.68
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ODC1-204ENST00000446285 VPS50Q96JG6 964 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 DPH7Q9BTV6 452 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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ODC1-204ENST00000446285 MED16Q9Y2X0 877 aa25.53■■□□□ 1.68
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ODC1-204ENST00000446285 HYKKA2RU49 373 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 ERVK-10P10266 1014 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 MMP11P24347 488 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 EMP3P54852 163 aa25.52■■□□□ 1.68
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ODC1-204ENST00000446285 MYBPC3Q14896 1274 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 NADK2Q4G0N4 442 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 ZNF549Q6P9A3 640 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 KCNMB4Q86W47 210 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 ASB11Q8WXH4 323 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 PKP4Q99569 1192 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 PCYOX1Q9UHG3 505 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-204ENST00000446285 AGPSO00116 658 aa25.51■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB14O43829 449 aa25.51■■□□□ 1.67
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ODC1-204ENST00000446285 COX15Q7KZN9 410 aa25.51■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 GALNT16Q8N428 558 aa25.51■■□□□ 1.67
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ODC1-204ENST00000446285 CD200R1Q8TD46 325 aa25.5■■□□□ 1.67
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ODC1-204ENST00000446285 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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ODC1-204ENST00000446285 KIAA0408Q6ZU52 694 aa25.49■■□□□ 1.67
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ODC1-204ENST00000446285 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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ODC1-204ENST00000446285 TM9SF4Q92544 642 aa25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 MVB12AQ96EY5 273 aa25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 SEMA3GQ9NS98 782 aa25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 TAC3Q9UHF0 121 aa25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ODC1-204ENST00000446285 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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