RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	SPC42	P36094	363 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	OSH7	P38755	437 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	MRL1	Q06815	381 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	DPH6	Q12429	685 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	EDE1	P34216	1381 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	CCP1	P00431	361 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	PRI2	P20457	528 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	SHU2	P38957	223 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	PIC2	P40035	300 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	YNR040W	P53736	256 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	FUS1	P11710	512 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	DUR3	P33413	735 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	DJP1	P40564	432 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	XKS1	P42826	600 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	GYP7	P48365	746 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	YNL050C	P53952	270 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	GCR1	P07261	785 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	MAM1	P40065	302 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	TCB2	P48231	1178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	HEH2	Q03281	663 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	RPN4	Q03465	531 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	OPI10	Q08202	246 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	DUT1	P33317	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	RIM11	P38615	370 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	PEX28	P38848	579 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	YJL181W	P46987	611 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	DSD1	P53095	428 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	YGR053C	P53234	283 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	PEX13	P80667	386 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	BDF2	Q07442	638 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	TAF13	P11747	167 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	IDI1	P15496	288 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	NPR1	P22211	790 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	MNN4	P36044	1178 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PSH1	YOL054W	RAD50	P12753	1312 aa		6.65	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YRF1-2	P40105	1681 aa		6.65	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	CIT2	P08679	460 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	BAS1	P22035	811 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.64	□□□□□ -1.35	not detected
PSH1	YOL054W	RRT14	P40470	206 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	LYS5	P50113	272 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	SRT1	Q03175	343 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	RAD4	P14736	754 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	MDJ1	P35191	511 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	TIM54	P47045	478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	HUL5	P53119	910 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	NKP2	Q06162	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	PHM7	Q12252	991 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	GLO4	Q12320	285 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	TY4B-J	P47024	1803 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	MSH3	P25336	1018 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YKL077W	P36081	392 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YGL140C	P53120	1219 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	ALG12	P53730	551 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.62	□□□□□ -1.35	not detected
PSH1	YOL054W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	SPO20	Q04359	397 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YIL177C	P40434	1758 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YJL225C	P40889	1758 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	NUP145	P49687	1317 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	FPS1	P23900	669 aa		6.61	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	DIT1	P21623	536 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	FET4	P40988	552 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	JJJ3	P47138	172 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	YJR124C	P47159	448 aa		6.6	□□□□□ -1.35
PSH1	YOL054W	EEB1	Q02891	456 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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