RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603043.1

CDCA3-211, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2

Gene CDCA3, Length 1,995 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-211ENST00000603043 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.54■□□□□ 0.88
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CDCA3-211ENST00000603043 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CDCA3-211ENST00000603043 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CDCA3-211ENST00000603043 MCM10Q7L590 875 aa20.54■□□□□ 0.88
CDCA3-211ENST00000603043 RIPK4P57078 832 aa20.53■□□□□ 0.88
CDCA3-211ENST00000603043 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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CDCA3-211ENST00000603043 DCTN1Q14203 1278 aa20.52■□□□□ 0.87
CDCA3-211ENST00000603043 NEUROD2Q15784 382 aa20.52■□□□□ 0.87
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CDCA3-211ENST00000603043 TXNRD1Q16881 649 aa20.5■□□□□ 0.87
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CDCA3-211ENST00000603043 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.44■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 SLC39A6Q13433 755 aa20.44■□□□□ 0.86
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CDCA3-211ENST00000603043 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.43■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.43■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.43■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 KCNQ4P56696 695 aa20.43■□□□□ 0.86
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CDCA3-211ENST00000603043 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 ZNF790Q6PG37 636 aa20.41■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.41■□□□□ 0.86
CDCA3-211ENST00000603043 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.41■□□□□ 0.86
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CDCA3-211ENST00000603043 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CDCA3-211ENST00000603043 TJP1Q07157 1748 aa20.38■□□□□ 0.85
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CDCA3-211ENST00000603043 NGEFQ8N5V2 710 aa20.34■□□□□ 0.85
CDCA3-211ENST00000603043 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.34■□□□□ 0.85
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CDCA3-211ENST00000603043 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.28■□□□□ 0.84
CDCA3-211ENST00000603043 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CDCA3-211ENST00000603043 MBIPQ9NS73 344 aa20.28■□□□□ 0.84
CDCA3-211ENST00000603043 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CDCA3-211ENST00000603043 WDR63Q8IWG1 891 aa20.27■□□□□ 0.84
CDCA3-211ENST00000603043 IL16Q14005 1332 aa20.27■□□□□ 0.84
CDCA3-211ENST00000603043 STARD3NLO95772 234 aa20.26■□□□□ 0.83
CDCA3-211ENST00000603043 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CDCA3-211ENST00000603043 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CDCA3-211ENST00000603043 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.26■□□□□ 0.83
CDCA3-211ENST00000603043 GNPATO15228 680 aa20.26■□□□□ 0.83
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