RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 EYA1Q99502 592 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRS-208ENST00000590509 TOMM70O94826 608 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 APLP1P51693 650 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 KDRP35968 1356 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 WDR90Q96KV7 1748 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 PHKG2P15735 406 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 DPEP1P16444 411 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 KCNA3P22001 575 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 SPG7Q9UQ90 795 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 C4AP0C0L4 1744 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 TGFB2P61812 414 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 TMF1P82094 1093 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRS-208ENST00000590509 GYS1P13807 737 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRS-208ENST00000590509 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 FCHSD2O94868 740 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.172e-12■□□□□ 9.3
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PTPRS-208ENST00000590509 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRS-208ENST00000590509 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 KLRG1Q96E93 195 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 SBF1O95248 1867 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 SLC24A1O60721 1099 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 RPS6KA4O75676 772 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 DDR1Q08345 913 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 CHRNA5P30532 468 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 JMYQ8N9B5 988 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRS-208ENST00000590509 DCAF5Q96JK2 942 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 RRAGCQ9HB90 399 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 TJP1Q07157 1748 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRS-208ENST00000590509 RFC4P35249 363 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRS-208ENST00000590509 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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PTPRS-208ENST00000590509 PCNTO95613 3336 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 ADRA2BP18089 450 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 RNF181Q9P0P0 153 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 PIM2Q9P1W9 311 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 RASSF7Q02833 373 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 FSTL1Q12841 308 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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PTPRS-208ENST00000590509 CABP4P57796 275 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRS-208ENST00000590509 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TM4SF1P30408 202 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 CDCA8Q53HL2 280 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TNS4Q8IZW8 715 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 MTHFSP49914 203 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.15■■□□□ 1.14
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PTPRS-208ENST00000590509 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRS-208ENST00000590509 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 POTECB2RU33 542 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 NFIXQ14938 502 aa22.12■■□□□ 1.13
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