RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP27B1O15528 508 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXB7P09629 217 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF5Q96JK2 942 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD11A6QL63 1104 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 NRAPQ86VF7 1730 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 DISP2A7MBM2 1401 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC4O15439 1325 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRCP08575 1304 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNA1FO60840 1977 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 JCADQ9P266 1359 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNQ3O43525 872 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS12O14924 1447 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A2P04920 1241 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 SLIT2O94813 1529 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS2O95450 1211 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 STK31Q9BXU1 1019 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-207ENST00000589146 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF790Q6PG37 636 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 CABP4P57796 275 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 G2E3Q7L622 706 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-207ENST00000589146 USP35Q9P2H5 1018 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 FLIIQ13045 1269 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 LRP6O75581 1613 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 PAPPAQ13219 1627 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHDP01880 384 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A6Q13433 755 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 TNS2Q63HR2 1409 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 BARGINQ6ZT62 677 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC5O00471 708 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 NECTIN2Q92692 538 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 GLI3P10071 1580 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 C5P01031 1676 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS72Q15906 364 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-207ENST00000589146 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA1LP34931 641 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 NGLY1Q96IV0 654 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 HYPKQ9NX55 129 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 F6X3S4 739 aa28.74■■■□□ 2.19
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