RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 ANP32CO43423 234 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 NEFMP07197 916 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 ATG3Q9NT62 314 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 LY75O60449 1722 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 STK32BQ9NY57 414 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC15A2Q16348 729 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC184Q52MB2 194 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 IL17REQ8NFR9 667 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-211ENST00000588374 PALLDQ8WX93 1383 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V1AP38606 617 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TEFQ10587 303 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC39A6Q13433 755 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 DCTN1Q14203 1278 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SIK1P57059 783 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF827Q17R98 1081 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 MCM10Q7L590 875 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K5Q99683 1374 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 NEUROD2Q15784 382 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 NFE2L2Q16236 605 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 AKT1S1Q96B36 256 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 RIPK4P57078 832 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ITPK1Q13572 414 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM5Q71RC9 77 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 RUNDC1Q96C34 613 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 C5P01031 1676 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 BTBD11A6QL63 1104 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNQ3O43525 872 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB7AO95365 584 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 MRS2Q9HD23 443 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC4A2P04920 1241 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 AK7Q96M32 723 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 PAPPAQ13219 1627 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 C4BP0C0L5 1744 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF14O94880 888 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF790Q6PG37 636 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SPON1Q9HCB6 807 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CASZ1Q86V15 1759 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 APAF1O14727 1248 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 GNPATO15228 680 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms