RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.35■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 PHF14O94880 888 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 ATP6V1AP38606 617 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 CABP4P57796 275 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 ITPK1Q13572 414 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTIF-203ENST00000587752 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.31■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 GNPATO15228 680 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 MAP3K5Q99683 1374 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 LGR6Q9HBX8 967 aa20.27■□□□□ 0.84
CTIF-203ENST00000587752 YY1P25490 414 aa20.26■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 SSFA2P28290 1259 aa20.25■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.24■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 PPP2R1AP30153 589 aa20.23■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 CFAP53Q96M91 514 aa20.23■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.23■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 GPR162Q16538 588 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.21■□□□□ 0.83
CTIF-203ENST00000587752 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 SLC39A6Q13433 755 aa20.2■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.19■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.19■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 RPS6KA4O75676 772 aa20.17■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 PRKAR2BP31323 418 aa20.17■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 NUDCQ9Y266 331 aa20.17■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 MRC1P22897 1456 aa20.17■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 TJP1Q07157 1748 aa20.16■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.16■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.16■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.16■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.15■□□□□ 0.82
CTIF-203ENST00000587752 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 MMP10P09238 476 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 RFC4P35249 363 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 IL17REQ8NFR9 667 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.14■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 ADRA2BP18089 450 aa20.13■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 CHD4Q14839 1912 aa20.12■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 TEFQ10587 303 aa20.12■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.12■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.12■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 C4AP0C0L4 1744 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 GYS1P13807 737 aa20.1■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.1■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.1■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.09■□□□□ 0.81
CTIF-203ENST00000587752 FCHSD2O94868 740 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 FKBP8Q14318 412 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 ZNF790Q6PG37 636 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 MCM10Q7L590 875 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 KCNQ3O43525 872 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 GRIN3BO60391 1043 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 DCTN1Q14203 1278 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 BTBD11A6QL63 1104 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 ZPR1O75312 459 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-203ENST00000587752 COL15A1P39059 1388 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms