RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 UTRNP46939 3433 aa34.67■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 PHF14O94880 888 aa34.66■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 ATP6V1AP38606 617 aa34.66■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 GPR162Q16538 588 aa34.65■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
SPNS1-209ENST00000567771 UBR3Q6ZT12 1888 aa34.63■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 KDRP35968 1356 aa34.62■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 MTHFSP49914 203 aa34.62■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 SSFA2P28290 1259 aa34.6■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 CABP4P57796 275 aa34.59■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.59■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 SLC4A9Q96Q91 983 aa34.59■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 GNPATO15228 680 aa34.58■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
SPNS1-209ENST00000567771 CHD4Q14839 1912 aa34.53■■■■□ 3.12
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
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SPNS1-209ENST00000567771 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa34.51■■■■□ 3.12
SPNS1-209ENST00000567771 CD2APQ9Y5K6 639 aa34.51■■■■□ 3.12
SPNS1-209ENST00000567771 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
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SPNS1-209ENST00000567771 ZNF831Q5JPB2 1677 aa34.48■■■■□ 3.11
SPNS1-209ENST00000567771 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.48■■■■□ 3.11
SPNS1-209ENST00000567771 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.48■■■■□ 3.11
SPNS1-209ENST00000567771 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
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SPNS1-209ENST00000567771 TRAPPC3LQ5T215 181 aa34.44■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa34.44■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 LGR6Q9HBX8 967 aa34.43■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.42■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 GRIN3BO60391 1043 aa34.41■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 RPS6KA4O75676 772 aa34.4■■■■□ 3.1
SPNS1-209ENST00000567771 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
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SPNS1-209ENST00000567771 SLC52A2Q9HAB3 445 aa34.39■■■■□ 3.1
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SPNS1-209ENST00000567771 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
SPNS1-209ENST00000567771 MMP10P09238 476 aa34.37■■■■□ 3.09
SPNS1-209ENST00000567771 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
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SPNS1-209ENST00000567771 RFC4P35249 363 aa34.34■■■■□ 3.09
SPNS1-209ENST00000567771 NLGN1Q8N2Q7 840 aa34.34■■■■□ 3.09
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SPNS1-209ENST00000567771 WWC3Q9ULE0 1092 aa34.32■■■■□ 3.08
SPNS1-209ENST00000567771 MRC1P22897 1456 aa34.32■■■■□ 3.08
SPNS1-209ENST00000567771 TJP1Q07157 1748 aa34.31■■■■□ 3.08
SPNS1-209ENST00000567771 SLC39A6Q13433 755 aa34.3■■■■□ 3.08
SPNS1-209ENST00000567771 DNAJC10Q8IXB1 793 aa34.28■■■■□ 3.08
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SPNS1-209ENST00000567771 CCDC87Q9NVE4 849 aa34.21■■■■□ 3.07
SPNS1-209ENST00000567771 PARP3Q9Y6F1 533 aa34.21■■■■□ 3.07
SPNS1-209ENST00000567771 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
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SPNS1-209ENST00000567771 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
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SPNS1-209ENST00000567771 CFAP53Q96M91 514 aa34.2■■■■□ 3.07
SPNS1-209ENST00000567771 KIF13BQ9NQT8 1826 aa34.2■■■■□ 3.07
SPNS1-209ENST00000567771 C10orf71Q711Q0 1435 aa34.2■■■■□ 3.06
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SPNS1-209ENST00000567771 IL17REQ8NFR9 667 aa34.19■■■■□ 3.06
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SPNS1-209ENST00000567771 C1QTNF8P60827 252 aa34.14■■■■□ 3.06
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SPNS1-209ENST00000567771 ATP10DQ9P241 1426 aa34.13■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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SPNS1-209ENST00000567771 UBR2Q8IWV8 1755 aa34.11■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 ZPR1O75312 459 aa34.11■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 DPEP1P16444 411 aa34.11■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 TM4SF1P30408 202 aa34.09■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 BCS1LQ9Y276 419 aa34.09■■■■□ 3.05
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