RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, human

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIPC-208	ENST00000557115	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CIPC-208	ENST00000557115	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
CIPC-208	ENST00000557115	C4B	P0C0L5	1744 aa		29.45	■■■□□ 2.31
CIPC-208	ENST00000557115	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	ITPK1	Q13572	414 aa		29.44	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	SMIM5	Q71RC9	77 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	GNPAT	O15228	680 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	SSFA2	P28290	1259 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.41	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	KDR	P35968	1356 aa		29.4	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.4	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	HMOX1	P09601	288 aa		29.39	■■■□□ 2.3
CIPC-208	ENST00000557115	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIPC-208	ENST00000557115	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIPC-208	ENST00000557115	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIPC-208	ENST00000557115	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
CIPC-208	ENST00000557115	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
CIPC-208	ENST00000557115	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIPC-208	ENST00000557115	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	ADRA2B	P18089	450 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	UTRN	P46939	3433 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	RPS6KA4	O75676	772 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	29.24	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	RFC4	P35249	363 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	MMP10	P09238	476 aa		29.23	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	CFAP53	Q96M91	514 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.21	■■■□□ 2.27
CIPC-208	ENST00000557115	CHD4	Q14839	1912 aa		29.19	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	SLC39A6	Q13433	755 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		29.16	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	GYS1	P13807	737 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	NUDC	Q9Y266	331 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CIPC-208	ENST00000557115	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	MRC1	P22897	1456 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	PPP2R1A	P30153	589 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	TEF	Q10587	303 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	PRKAR2B	P31323	418 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CIPC-208	ENST00000557115	ZPR1	O75312	459 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	TGFB2	P61812	414 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	TJP1	Q07157	1748 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	FKBP8	Q14318	412 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115		A0A0G2JLW4	131 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CIPC-208	ENST00000557115	STARD3NL	O95772	234 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		29	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF790	Q6PG37	636 aa		29	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	BCS1L	Q9Y276	419 aa		29	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	C4A	P0C0L4	1744 aa		29	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	FCHSD2	O94868	740 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	DPEP1	P16444	411 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
CIPC-208	ENST00000557115	COL15A1	P39059	1388 aa		28.98	■■■□□ 2.23

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