RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
CS-212ENST00000548567 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-212ENST00000548567 GRM1Q13255 1194 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 NEFMP07197 916 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 PTGER2P43116 358 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 MTFR1LQ9H019 292 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 USP16Q9Y5T5 823 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 OLFM4Q6UX06 510 aa10.01□□□□□ -0.81
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CS-212ENST00000548567 PIK3C2AO00443 1686 aa10.01□□□□□ -0.81
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CS-212ENST00000548567 IL13P35225 146 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 PPP2R1AP30153 589 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
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CS-212ENST00000548567 FCHSD2O94868 740 aa10□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.819e-10■■□□□ 12.1
CS-212ENST00000548567 IL17REQ8NFR9 667 aa10□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 BTBD11A6QL63 1104 aa10□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 ZPR1O75312 459 aa10□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 KIF1AQ12756 1690 aa10□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 LAMC1P11047 1609 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 INSRP06213 1382 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 NUDCQ9Y266 331 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
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CS-212ENST00000548567 ALS2Q96Q42 1657 aa9.96□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 RIPK4P57078 832 aa9.96□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.96□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 USP31Q70CQ4 1352 aa9.96□□□□□ -0.81
CS-212ENST00000548567 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 DPEP1P16444 411 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 SYNE4Q8N205 404 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 APAF1O14727 1248 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 AKT1S1Q96B36 256 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 MRS2Q9HD23 443 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 TNS2Q63HR2 1409 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 ADGRB2O60241 1585 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 C21orf2O43822 256 aa9.93□□□□□ -0.82
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CS-212ENST00000548567 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 RASSF7Q02833 373 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 ZNF790Q6PG37 636 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 CAPN15O75808 1086 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 GYS1P13807 737 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 NFIXQ14938 502 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 DDR1Q08345 913 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 HLFQ16534 295 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-212ENST00000548567 PROSER3Q2NL68 480 aa9.9□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 ITSN1Q15811 1721 aa9.9□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 RNF181Q9P0P0 153 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 STARD3NLO95772 234 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 SERPINB2P05120 415 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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CS-212ENST00000548567 ABCA3Q99758 1704 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 NSD2O96028 1365 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 LTN1O94822 1766 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-212ENST00000548567 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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