RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 HTRA3P83110 453 aa22.56■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.56■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 CCDC184Q52MB2 194 aa22.55■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 SMIM5Q71RC9 77 aa22.55■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 TOMM70O94826 608 aa22.53■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 JMYQ8N9B5 988 aa22.53■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 NCAPD2Q15021 1401 aa22.52■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 IL13P35225 146 aa22.52■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.52■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 MRS2Q9HD23 443 aa22.51■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.51■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 KLRG1Q96E93 195 aa22.49■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.48■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 PRELPP51888 382 aa22.48■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 PALLDQ8WX93 1383 aa22.46■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 ITGB4P16144 1822 aa22.45■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
PACS1-208ENST00000529677 NUDCQ9Y266 331 aa22.45■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 KDRP35968 1356 aa22.45■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.44■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 TNS4Q8IZW8 715 aa22.43■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 EYA1Q99502 592 aa22.43■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.41■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.4■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.4■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 NBPF4Q96M43 638 aa22.4■■□□□ 1.18
PACS1-208ENST00000529677 PHF14O94880 888 aa22.39■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.37■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.36■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.36■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 FCHSD2O94868 740 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 AK7Q96M32 723 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 SSFA2P28290 1259 aa22.33■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.33■■□□□ 1.17
PACS1-208ENST00000529677 CYP27B1O15528 508 aa22.32■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 BCS1LQ9Y276 419 aa22.32■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 A0A0G2JLW4 131 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 HMOX1P09601 288 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 FSTL1Q12841 308 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 MMP10P09238 476 aa22.3■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.3■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 C4AP0C0L4 1744 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 ITPK1Q13572 414 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 SLC34A2O95436 690 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 PRKAR2BP31323 418 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 PIGBQ92521 554 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 SBF1O95248 1867 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 DPEP1P16444 411 aa22.27■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 KCNA3P22001 575 aa22.27■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 TGFB2P61812 414 aa22.27■■□□□ 1.16
PACS1-208ENST00000529677 RUNDC1Q96C34 613 aa22.26■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 GNPATO15228 680 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 SIK1P57059 783 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 RRAGCQ9HB90 399 aa22.22■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-208ENST00000529677 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.2■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.19■■□□□ 1.14
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